Rozdiel medzi VNTR a sondou

kľúčový rozdiel medzi VNTR a sondou je to VNTR je krátka nukleotidová sekvencia vyskytujúca sa ako tandemová repetícia v genóme, zatiaľ čo sonda je umelo syntetizovaná krátka sekvencia DNA alebo RNA, ktorá by mohla byť rádioaktívne značená.

VNTR je skratka pre tandemové opakovanie premenných čísel. Je to krátka nukleotidová sekvencia organizovaná v tandemovom opakovaní v genóme. VNTR sa prirodzene vyskytujú v našom genóme. Sonda je umelo syntetizovaná krátka sekvencia DNA alebo RNA. Sonda aj VNTR sú nukleové kyseliny alebo krátke nukleotidové sekvencie. Majú obrovské využitie v rôznych molekulárno-biologických technikách, najmä vo forenzných štúdiách. VNTR a sonda zdieľajú niektoré podobnosti a rozdiely. Článok sa preto pokúša zdôrazniť rozdiel medzi VNTR a sondou.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to VNTR
3. Čo je sonda
4. Podobnosti medzi VNTR a sondou
5. Porovnanie vedľa seba - VNTR vs sonda v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je to VNTR?

VNTR je krátka nukleotidová sekvencia, ktorá v našom genóme existuje ako tandemová repetícia. VNTR sú prítomné v mnohých chromozómoch. Ďalej, VNTR sa líšia medzi rôznymi jedincami od dĺžok, pretože počet opakovaní sa líši vo VNTR rôznych ľudí. V podstate je to kvôli alelám zdedeným od ich rodičov. Preto používame hlavne VNTR na identifikáciu rodičov (dedičnosť) alebo na osobné účely. Podobne je možné ich použiť aj v genetike, forenznej analýze, biologickom výskume a snímaní DNA. Preto je VNTR dôležitým nástrojom v molekulárnej biológii.

Obrázok 01: VNTR

V dedičstve analyzujeme údaje VNTR pomocou dvoch základných princípov: dedičnosť a identita. Počas porovnávania dedičstva musí mať jednotlivela porovnateľnú alelu s rodinou každého rodiča. Počas párovania identít musia byť obe alely VNTR prítomné na špecifickom mieste genómu.

Čo je sonda?

V kontexte molekulárnej biológie je sonda umelo syntetizovaný fragment DNA alebo RNA s dĺžkou 100 až 1000 báz. Tieto sondy môžeme rádioaktívne označiť. Preto ich používame na detekciu cieľových nukleotidových sekvencií, ktoré sú komplementárne so sekvenciou sondy. Keď do vzorky pridáme sondy, uskutoční sa hybridizácia s komplementárnymi sekvenciami alebo cieľovými sekvenciami a uľahčia nám identifikáciu cieľových sekvencií. Pretože sondy nesú rádioaktivitu, môžeme ich ľahko zistiť.

Obrázok 02: Sonda

Vo forenznej vede bežne používame sondy v technikách profilovania DNA, ako je detekcia krátkych tandemových opakujúcich sa oblastí, polymorfizmy s dĺžkou reštrikčných fragmentov a snímanie DNA..

Aké sú podobnosti medzi VNTR a sondou?

• Nukleové kyseliny sú stavebnými kameňmi VNTR a sondy.
• Používame ich v procesoch génovej identifikácie.
• Obidve ich dĺžky sú tiež rôzne.
• Sú dôležitými nástrojmi pri forenzných štúdiách, odoberaní DNA, genetike atď.

Aký je rozdiel medzi VNTR a sondou?

VNTR je oblasť genómu usporiadaná ako tandemové repetície, zatiaľ čo sonda je krátka sekvencia DNA alebo RNA syntetizovaná umelo, aby sa detegovali cieľové sekvencie vo vzorke. Toto je kľúčový rozdiel medzi VNTR a sondou. Dôležitým rozdielom medzi VNTR a sondou je tiež to, že na rozdiel od VNTR môžeme sondy rádioaktívne označiť.

Okrem toho VNTR väčšinou vykonávajú rodičovskú identifikáciu, zatiaľ čo sondy pomáhajú detekovať cieľové nukleotidové sekvencie vo vzorkách DNA alebo RNA, ktoré sú komplementárne so sekvenciou sondy. Preto je to tiež významný rozdiel medzi VNTR a sondou.

Nasledujúci infographic poskytuje viac informácií o rozdieloch medzi VNTR a sondou.

Zhrnutie - VNTR vs Probe

Bežné použitie VNTR a sondy je v technikách molekulárnej analýzy, ako sú forenzné štúdie a DNA fingerprinting. Obidve pozostávajú z rôznych dĺžok. Kľúčový rozdiel medzi VNTR a sondou je však v tom, že VNTR je oblasť genómu usporiadaná s tandemovými opakovaniami, zatiaľ čo sonda je fragment DNA alebo RNA, ktorý by mohol byť rádioaktívne značený. Okrem toho sú VNTR prítomné v genóme. Sondy sú ale umelo syntetizované a mohli by byť značené rádioaktívne na detekciu cieľových nukleotidových sekvencií vo vzorkách DNA alebo RNA, ktoré sú komplementárne so sekvenciou v sonde. Toto je zhrnutie rozdielu medzi VNTR a sondou.

referencie:

1. „Variabilný počet tandemových repetícií (VNTR) a jeho aplikácia v bakteriálnej epidemiológii.“ Science Alert: Journal, k dispozícii tu.
2. „Sonda DNA.“ Nature News, Nature Publishing Group, k dispozícii tu.

S láskavým dovolením:

1. „D1S80Demo“ Autor: PaleWhaleGail na anglickej Wikipédii (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Molekulárne majáky“ (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia