Rozdiel medzi zložením Alpha Helix a Beta

Kľúčový rozdiel - Alpha Helix verzus Beta Skladaný hárok
 

Alfa helixy a beta skladané listy sú dve najčastejšie nájdené sekundárne štruktúry v polypeptidovom reťazci. Tieto dve štrukturálne zložky sú prvé hlavné kroky v procese skladania polypeptidového reťazca. kľúčový rozdiel medzi Alpha Helix a Beta Skladaný list je v ich štruktúra; majú dva rôzne tvary na vykonávanie konkrétnej práce.

Čo je Alpha Helix?

Alfa helix je pravotočivá cievka aminokyselinových zvyškov na polypeptidovom reťazci. Rozsah aminokyselinových zvyškov sa môže meniť od 4 do 40 zvyškov. Vodíkové väzby vytvorené medzi kyslíkom skupiny C = O na hornej cievke a vodíkom skupiny N-H v spodnej cievke pomáhajú udržiavať cievku pohromade. Vodíková väzba sa vytvorí na každé štyri aminokyselinové zvyšky v reťazci vyššie uvedeným spôsobom. Tento jednotný vzor mu dáva určité vlastnosti, ako je hrúbka cievky a určuje dĺžku každého úplného závitu pozdĺž osi špirály. Stabilita alfa helixovej štruktúry závisí od niekoľkých faktorov.

O atómy v červenej farbe, N atómy v modrej a vodíkové väzby ako zelené bodkované čiary

Čo je to skladaný list Beta?

Skladaný list beta, tiež známy ako list beta, sa považuje za druhú formu sekundárnej štruktúry proteínov. Obsahuje beta vlákna, ktoré sú bočne spojené najmenej dvoma alebo tromi vodíkovými väzbami chrbtovej kosti, aby vytvorili skrútenú skladanú vrstvu, ako je to znázornené na obrázku. Beta vlákno je úsek polypeptidového reťazca; jeho dĺžka je všeobecne rovná 3 až 10 aminokyselinám, vrátane hlavného reťazca v rozšírenom potvrdení.

4-vláknový antiparalelný fragment P listu z kryštalickej štruktúry enzýmu katalázy.
a) zobrazenie antiparalelných vodíkových väzieb (bodkovaných) medzi peptidovými skupinami NH a CO na susedných vláknach. Šípky označujú smer reťazca a obrysy elektrónovej hustoty naznačujú atómy iné ako H. O atómy sú červené gule, atómy N sú modré a atómy vodíka sú pre jednoduchosť vynechané; vedľajšie reťazce sa zobrazujú iba pri prvom atóme bočného reťazca C (zelená)
b) Okrajový pohľad na stredné dva p vlákna

V hárkoch skladaných v beta verzii prebiehajú polypeptidové reťazce vedľa seba. Vďaka vlnovitému vzhľadu štruktúry dostáva názov „skladaný list“. Sú vzájomne spojené vodíkovými väzbami. Táto štruktúra umožňuje vytvorenie väčšieho množstva vodíkových väzieb natiahnutím polypeptidového reťazca.

Aký je rozdiel medzi Alpha Helix a Beta Skladaný hárok?

Štruktúra skladaného listu Alpha Helix a Beta

Alfa Helix:

V tejto štruktúre je polypeptidový hlavný reťazec pevne viazaný okolo imaginárnej osi ako špirálová štruktúra. Je tiež známa ako helikoidné usporiadanie peptidového reťazca.

K tvorbe alfa helixovej štruktúry dochádza, keď sú polypeptidové reťazce skrútené do špirály. To umožňuje, aby všetky aminokyseliny v reťazci spolu tvorili vodíkové väzby (väzba medzi molekulou kyslíka a molekulou vodíka). Vodíkové väzby umožňujú špirále držať špirálovitý tvar a poskytujú pevnú cievku. Vďaka tomuto tvaru špirály je alfa helix veľmi silný.

Vodíkové väzby sú označené žltými bodkami.

Skladaný list Beta:

Keď sa dva alebo viac fragmentov polypeptidového reťazca (reťazcov) prekrývajú jeden s druhým a tvoria medzi sebou rad vodíkových väzieb, možno nájsť nasledujúce štruktúry. Môže sa to stať dvoma spôsobmi; paralelné a antiparalelné usporiadanie.

Príklady štruktúry:

Alfa Helix: Nechty alebo nechty na nohách sa môžu brať ako príklad štruktúry alfa skrutkovice.

Skladaný list Beta: Štruktúra peria je podobná ako štruktúra skladaného listu beta.

Vlastnosti štruktúry:

Alfa Helix: V alfa helixovej štruktúre existuje 3,6 aminokyselín na otáčku helixu. Všetky peptidové väzby sú trans a planárne a skupiny N-H v peptidových väzbách smerujú rovnakým smerom, ktorý je približne rovnobežný s osou špirály. Skupiny C = O všetkých peptidových väzieb smerujú opačným smerom a sú rovnobežné s osou špirály. Skupina C = O každej peptidovej väzby je naviazaná na skupinu N-H peptidovej väzby, ktorá tvorí vodíkovú väzbu. Všetky skupiny R- sú vyznačené smerom von od špirály.

Skladaný list Beta: Každá peptidová väzba v beta skladanom liste je rovinná a má trans-konformáciu. Skupiny C = O a N-H peptidových väzieb zo susedných reťazcov sú v rovnakej rovine a smerujú k sebe navzájom a vytvárajú vodíkovú väzbu medzi nimi. Všetky skupiny R- v ktoromkoľvek reťazci sa môžu alternatívne vyskytovať nad a pod rovinou listu.

definícia:

Sekundárna štruktúra: Je to tvar skladacieho proteínu spôsobený vodíkovou väzbou medzi jeho amidom hlavného reťazca a karbonylovými skupinami.

Odkazy: „Štruktúra proteínov“. ChemWiki: The Dynamic Chemistry Hypertext „Sekundárna štruktúra proteínov: α-helixy a β-listy“. Proteinstructures.com Salam Al Karadaghi „Organic Chemistry“. Učebnica virtuálnych buniek „Beta Sheet“ .Wikipedia Obrazová zdvorilost: „Helix elektrónová hustota myoglobínu 2nrl 17-32“ od Dcrjsr - vlastná práca (CC BY 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia „Proteínová sekundárna štruktúra“ od používateľa: Užívateľ: Bikadi (CC BY) -SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia „1gwe antipar beta Sheet both“ od Dcrjsr - Vlastné dielo (CC BY 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia