Rozdiel medzi Cosmidom a Phagemidom

kľúčový rozdiel medzi Cosmid a Phagemid je o type sekvencií, ktoré obsahuje. Kozmid obsahuje miesto cos a plazmid. Preto je to hybridný vektor, zatiaľ čo fagemid je plazmid, ktorý obsahuje začiatok replikácie fága F1.

Kozmidy a fagemidy sa používajú na klonovanie, najmä na klonovanie väčších fragmentov DNA. Tieto sa široko používajú najmä v klonovacích génoch zodpovedných za produkciu rôznych proteínov. Kozmidy a fagemidy sa buď replikujú samotné ako plazmidy alebo sa balia do vírusových častíc a potom sa replikujú.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to Cosmid
3. Čo je Phagemid
4. Podobnosti medzi Cosmidom a Phagemidom
5. Porovnanie vedľa seba - Cosmid vs Phagemid v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je to Cosmid?

Kozmid, označovaný ako hybridný plazmid, obsahuje cos miesta extrahované z fágových častíc Lambda a plazmid. Tieto cos miesta sú dlhé fragmenty DNA s 200 bázovými pármi. Preto majú kohézne alebo lepkavé konce, ktoré umožňujú plazmidu zapadnúť do vírusovej DNA. Z tohto dôvodu sú stránky cos životne dôležité pre balenie DNA.

Existujú tri stránky cos;

  • miesto cosN - zapojené do vyrezávania reťazca DNA pomocou aktivity terminázy
  • miesto cosB - zapojené do držania terminázy.
  • miesto cosQ - zapojené do prevencie degradácie DNA DNázami.

Obrázok 01: Cosmid

Kozmidy môžu tiež replikovať jednovláknovú DNA alebo dvojvláknovú DNA pomocou vhodného začiatku replikácie. Kozmidy zvyčajne obsahujú gény rezistencie na antibiotiká ako markery pre výber transformantov. Takže použitie kozmidu ako vektora môže uľahčiť klonovanie a štiepenie reštrikčných enzýmov vo vektore môže potom tieto fragmenty extrahovať..

Čo je Phagemid (phasmid)?

Phagemid, tiež nazývaný phasmid, je tiež druh hybridného vektora. Phagemid obsahuje špeciálny začiatok replikácie nazývaný f1 začiatok replikácie. Počiatok replikácie sa extrahuje z fága f1.

Fagemid môže replikovať jednovláknovú aj dvojvláknovú DNA. Replikácia môže prebiehať buď ako plazmid počas nezávislej replikácie, alebo sa môže zabaliť do fágových častíc a nakoniec infikovať bakteriálneho hostiteľa. E coli. Pri nákaze E coli buniek f1 fág vyžaduje prítomnosť stĺpca. Preto sú sexuálne pili dôležité in vitro balenie fagemidov.

Aké sú podobnosti medzi Cosmidom a Phagemidom?

  • Cosmid aj Phagemid sú klonovacie vektory používané v technológii rekombinantnej DNA.
  • Cosmid a Phagemid môžu replikovať jednovláknovú a dvojvláknovú DNA.
  • Oba môžu podstúpiť nezávislú replikáciu podobnú plazmidom.
  • Cosmid a Phagemid môžu podstúpiť in vitro balenie a infikovanie bakteriálnych buniek.
  • Cosmid aj Phagemid vyžadujú na klonovanie vhodný začiatok replikácie.

Aký je rozdiel medzi Cosmidom a Phagemidom?

Cosmid vs Phagemid

Cosmid je hybridný vektor, ktorý obsahuje miesto cos a plazmid. Fagemid je plazmid, ktorý obsahuje začiatok replikácie fága F1.
 Prítomnosť stránok Cos
Miesta Cos sú prítomné vo vesmíre a sú potrebné na balenie in vitro. Vo fagemide chýbajú stránky Cos.
 Prítomnosť pôvodu replikácie F1
V kozmide sa môže alebo nemusí vyskytovať pôvod replikácie. F1 počiatok replikácie je prítomný vo fagemide.
Prítomnosť génov odolných voči antibiotikám
V kozmidoch sú prítomné gény odolné proti antibiotikám na identifikáciu transformantov z netransformantov. U fagemidov chýbajú gény rezistentné na antibiotiká.
Požiadavka balenia in vitro
Vyžaduje sa stránka cos. Vyžaduje sexuálny stĺp.

zhrnutie - Cosmid vs fagemidový

Cosmid a Phagemid sú klonovacie vektory používané v technológii rekombinantnej DNA. Kozmidy sú hybridné vektory, ktoré obsahujú špeciálne lepkavé konce známe ako miesta cos. in vitro balenie vyžaduje tieto stránky cos. Zatiaľ čo fagemidy sú plazmidy, ktoré obsahujú f1 počiatok replikácie extrahovanej z f1 fágu. Kozmid aj fagemid sa môžu podrobiť nezávislej replikácii alebo in vitro balenie do bakteriálnych buniek. Toto sú dôležité rozdiely medzi kozmidom a fagemidom.

referencie:

1.Qi, H, a kol. „Fagemidové vektory pre zobrazenie fágov: Vlastnosti, vlastnosti a konštrukcia.“ Journal of Molecular Biology., U.S. National Library of Medicine, 30. marca 2012. K dispozícii tu 
2.Collins, J a B Hohn. "Kozmidy: typ plazmidového génového klonovacieho vektora, ktorý je baliteľný in vitro v hlavách bakteriofágu Lambda." Zborník Národnej akadémie vied Spojených štátov amerických, Národná lekárska knižnica USA, september 1978. K dispozícii tu  

S láskavým dovolením:

1.'Cosmid (angličtina) 'Zlir'a (CC0) prostredníctvom Commons Wikimedia