Transkripcia je proces konverzie genetickej informácie uloženej v kódujúcej sekvencii DNA na sekvenciu mRNA. Tento proces iniciuje špecifická oblasť DNA umiestnená na 5 'konci transkripčnej jednotky. Táto oblasť je známa ako promótorová oblasť. Tieto promótory sa zvyčajne nachádzajú v susedstve štartovacieho miesta transkripcie. Dĺžka promótora sa pohybuje od 100 bp do 1 000 bp. Promótory sa líšia podľa typu organizmu. Eukaryotické a prokaryotické promótory sa navzájom líšia. V prokaryotoch sa nachádzajú iba tri typy promótorových sekvencií, a to -10 zakladateľs, -35 promótorových a protiprúdových prvkov. v eukaryota, existuje mnoho rôznych promótorových prvkov, ako je TATA box, iniciačné prvky, GC box, CAAT box atď. To je kľúčový rozdiel medzi eukaryotickými a prokaryotickými promótormi.
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo sú eukaryotické promótory
3. Čo sú prokaryotické promótory
4. Podobnosti medzi eukaryotickými a prokaryotickými promótormi
5. Porovnanie bok po boku - eukaryotické vs prokaryotické promótory v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie
Tri hlavné časti; jadrový promótor, proximálny promótor a distálny promótor, spoločne tvoria promótor. V kontexte eukaryotov sa nachádza veľa promótorových prvkov, ktoré sú vysoko sofistikované a rôznorodejšie ako promótory. Zistilo sa, že v dôsledku tejto komplexnosti eukaryotických promótorov je DNA schopná sa sama zložiť. To tiež vysvetľuje skutočnosť, že k účinku mnohých regulačných sekvencií dochádza, aj keď sú umiestnené mnoho kilobáz od miesta transkripcie. Tieto eukaryotické promótory majú schopnosť preklenúť širokú škálu DNA sekvencií.
Obrázok 01: Eukaryotický promótor
Príklady niektorých eukaryotických promótorov sú Pribnowov box (TATA box), GC box, CAAT box atď. V kontexte TATA box, je to sekvencia 5 '- TATAA -3', ktorá je prítomná v oblasti jadra promótora. Do políčka TATA sú naviazané proteíny transkripčného faktora a histónové proteíny. Väzba proteínov transkripčného faktora na TATA box pomáha pri väzbe RNA polymerázy, čo vedie k tvorbe transkripčného komplexu. Jednoducho povedané, väzba týchto proteínov bude riadiť proces transkripcie. Tento proces bude inhibovaný, keď sa histónové proteíny naviažu na TATA box. Preto je TATA box dôležitým promótorovým prvkom, ktorý zahŕňa reguláciu rýchlosti eukaryotickej transkripcie.
V prokaryotických organizmoch je promótor, ktorý sa zúčastňuje transkripcie, identifikovaný pridruženým faktorom nazývaným sigma faktor. Sigma faktory sú jedinečné pre rôzne promótorové sekvencie. Preto sa hovorí, že každý jednotlivý sigma faktor by rozpoznal jednu sekvenciu promótora jadra. Toto je jedinečná vlastnosť, ktorá je prítomná v prokaryotickom transkripčnom procese. RNA polymeráza aj sigma faktor spoločne identifikujú správny promótorový región a tvoria transkripčný komplex.
Prokaryotický promótor obsahuje iba tri typy promótorových prvkov. Menšie zapojenie promótorových prvkov do prokaryot je hlavným dôvodom, prečo je ich transkripčný proces menej sofistikovaný v porovnaní s eukaryotickou transkripciou, ktorá zahŕňa vyšší počet promótorových sekvencií. Z troch promótorových prvkov prokaryotov existujú dve hlavné dôležité dve krátke sekvencie DNA. Tieto sekvencie sú klasifikované podľa ich umiestnenia. Sú to -10 promótory alebo element (ktorý je prítomný 10 bp upstream od počiatočného miesta transkripcie), -35 promótor alebo element (ktorý je prítomný 35 bp upstream od počiatočného miesta transkripcie).
Obrázok 02: Prokaryotický promótor
Promótor -10 je ekvivalentný s eukaryotickým TATA boxom alebo Pribnow boxom a je nevyhnutnou súčasťou iniciácie transkripcie v prokaryotoch. Promótor -35 pozostáva zo sekvencie, ktorá je TTGACA, ktorá sa aktívne podieľa na regulácii rýchlosti prokaryotickej transkripcie.
Eukaryotické a prokaryotické promótory | |
Eukaryotické promótory sú regulačné sekvencie, ktoré iniciujú transkripciu eukaryotických organizmov. | Prokaryotické promótory sú regulačné sekvencie, ktoré iniciujú transkripciu prokaryotických génov. |
elements | |
Prokaryotický promótor pozostáva z protiprúdových prvkov, -10 elementov a -35 elementov. | Eukaryotický promótor pozostáva z Pribnowovho boxu (TATA box), CAAT boxu, GC boxu a iniciačných prvkov. |
Promótor je oblasť DNA, ktorá zahŕňa začatie procesu nazývaného transkripcia. Tieto promótory sa zvyčajne nachádzajú proti smeru od počiatočného miesta transkripcie. Tri hlavné časti, ktoré tvoria promótor, sú hlavný promótor, proximálny promótor a distálny promótor. V kontexte eukaryotov existuje v promótorovej oblasti veľa promótorových prvkov, ktoré sú vysoko sofistikované a rôznorodejšie ako prokaryoty. Príklady niektorých eukaryotických promótorových prvkov sú Pribnowov box (TATA box), GC box, CAAT box atď. V prokaryotoch sú dva hlavné dôležité promótorové prvky a to -10 element (ktorý je prítomný 10 bp proti smeru od počiatočného miesta transkripcie), -35 elementov (ktorá je prítomná 35 bp proti smeru od začiatočného miesta prepisu). Promótor -10 iniciuje transkripciu a promótor reguluje transkripciu. Oba typy promótorov sú riadené rôznymi regulačnými sekvenciami DNA, ktoré zahŕňajú zosilňovače, tlmiče, izolátory a hraničné prvky. Toto je rozdiel medzi eukaryotickými a prokaryotickými promótormi.
Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ju na účely offline podľa citácie. Stiahnite si PDF verziu tu: Rozdiel medzi eukaryotickým a prokaryotickým promótorom
1.Kdiaľ, A. „Štrukturálne vlastnosti promótorov: podobnosti a rozdiely medzi prokaryotmi a eukaryotmi.“ Nucleic Acids Research, zv. 33, č. 10, február 2005, s. 3165-3175., Doi: 10,1093 / nar / gki627.
2. "organizácií." Addgene. K dispozícii tu
1. 'Genová štruktúra eukaryota 2 s poznámkou „Autor: Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). „Eukaryotická a prokaryotická génová štruktúra“. WikiJournal of Medicine 4 (1). DOI: 10,15347 / WJM / 2017,002. ISSN 20024436., (CC BY 4.0) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. 'Obrázok 15 02 01' Autorom CNX OpenStax (CC BY 4.0) prostredníctvom Commons Wikimedia