Rozdiel medzi knockout Gene a knockdown

kľúčový rozdiel medzi knockout génov a knockdown je to knockout génu je technika, pri ktorej je požadovaný gén úplne odstránený (inoperačný stav) na štúdium funkcií génu knockdown génov je ďalšou technikou, pri ktorej je gén, ktorý je predmetom záujmu, umlčaný skúmať úlohu konkrétneho génu v biologickom systéme.

Fungujú rôzne genetické techniky na skúmanie fungovania génov v živých biologických systémoch. Génový knockout a knockdown sú dve takéto techniky. Tieto techniky pomáhajú vedcom identifikovať funkčné aspekty rôznych génov v živých organizmoch.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je Gene Knockout
3. Čo je to Gene Knockdown
4. Podobnosti medzi knockoutom Gene a knockdownom
5. Porovnanie vedľa seba - Gene Knockout vs Knockdown v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je Gene Knockout?

Génový knockout je genetická technika, ktorá spôsobuje, že jeden alebo viac génov nefunguje v živých organizmoch. Je to tiež proces vypínania alebo vymazania génu organizmu. Primárnou aplikáciou tejto techniky je štúdium génovej funkcie. Proces hodnotí účinok strateného alebo odstráneného génu. Vyraďovací proces zahŕňa aj určité enzýmy a techniky spájania.

Obrázok 01: Vyradenie génov

Existuje niekoľko variácií v technike knockoutov génov založených na počte zahrnutých génov. Oni sú dvojitý knockout (knockout dva gény), trojitý knockout (knockout troch génov) a štvornásobný knockout (knockout zo štyroch génov). Génový knockout je ďalej klasifikovaný do dvoch skupín; heterozygotné knockouty a homozygotné knockouty.

Čo je to Gene Knockdown?

Génový knockdown je experimentálny postup, pri ktorom tento postup potláča alebo znižuje expresiu konkrétneho génu alebo génov organizmu. Génové tlmenie je všeobecná definícia pre knockdown génov. Počas tohto postupu aktivácia alebo degradácia produkovanej mRNA zahŕňa RNA interferenciu (RNAi), malú interferujúcu RNA (siRNA) a krátku vlásenkovú RNA (shRNA)..

Obrázok 02: Génové tlmenie

Primárne použitie knockdownov génov je skúmanie úlohy konkrétneho génu v biologickom systéme. Táto technika preto uskutočňuje štúdium onkogénov (Bcl-2 a P53) a génov, ktoré spôsobujú neurologické choroby, vírusové infekcie a dedičné choroby..

Aké sú podobnosti medzi Gene Knockout a Knockdown?

• Génový knockout aj génový knockdown sú genetické techniky.
• Tieto dve techniky môžu zabrániť génovej expresii.
• Primárne použitie oboch techník je skúmanie funkcie génu, o ktorý je záujem.
• Obe sú schopné identifikovať rôzne chorobné stavy (genetické).
• Obidve sa môžu použiť na jeden alebo viac požadovaných génov.

Aký je rozdiel medzi Gene Knockout a Knockdown?

Gene Knockout vs Knockdown
Genové knockout je v prevádzke génov (odstraňovanie génov z DNA) organizmu rôznymi genetickými technikami.	Genové knockdown je experimentálny postup na potlačenie (zníženie alebo utlmenie) expresie konkrétneho génu alebo génov organizmu.
funkcie
Uľahčuje štúdium funkcií génov analýzou výsledkov strateného génu.	Uľahčuje štúdium onkogénov, génov, ktoré spôsobujú neurologické choroby, vírusové infekcie a dedičné choroby.
Zapojenie agentov RNA
Zapojenie agentov RNA je pri tejto technike zanedbateľné.	Tento proces zahrnuje látky ako je siRNA, shRNA a RNAi na inaktiváciu mRNA.
Použitie chemických látok
Používajú sa enzymatické činidlá.	Nepoužívajú sa žiadne takéto chemické látky.
Účinok na gén
Úplne odstráni gén z DNA.	Potlačiť alebo stíšiť gén.
klasifikácia
Dvojité knockout, triple knockout a quadruple knockout a heterozygotné a homozygotné knockout sú rôzne typy knockoutov génov.	Nie sú k dispozícii žiadne takéto klasifikačné systémy na umlčanie génov.

Zhrnutie - Gene Knockout vs Gene Knockdown

Tieto dve techniky sme diskutovali tu; génový knockout a knockdown, sú metódy na skúmanie funkcií rôznych génov. Génový knockout úplne robí gén nefunkčným, zatiaľ čo génový knockdown umlčí požadovaný gén. Obidve postupy však bránia expresii génov. Rôzne činidlá sú schopné uskutočniť tieto dva procesy. Knock-out génu je typ delécie, zatiaľ čo knockdown génu je typ inaktivácie. Toto je rozdiel medzi knock-outom a knockdownom.

referencie:

1. Shaffer, Catherine. "Gene Knockout verzus Knockdown." News-Medical.net, 12. februára 2018. K dispozícii tu  
2. „Gene Knockout.“ Nature News, Nature Publishing Group. K dispozícii tu

S láskavým dovolením:

1.'Knockout Mice5006-300'By Maggie Bartlett, NHGRI. (Public Domain) prostredníctvom Commons Wikimedia 
2.'RNAi-zjednodušený'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Výsadba semien nového paradigmy. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia