Rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi

Kľúčový rozdiel - všeobecne vs špecifické transkripčné faktory
 

RNA polymeráza vyžaduje transkripčné faktory, aby pôsobili na vlákno templátu DNA pri syntéze mRNA. Existujú rôzne typy transkripčných faktorov. Tieto transkripčné faktory tvoria komplex s reťazcom DNA. Buď menia potvrdenie templátového vlákna alebo zvyšujú afinitu enzýmu RNA polymerázy k syntéze mRNA v procese nazývanom transkripcia. Existujú dva hlavné typy transkripčných faktorov. Sú to všeobecné alebo základné transkripčné faktory a špecifické transkripčné faktory. Všeobecné transkripčné faktory sú faktory, ktoré sa používajú na vytvorenie pred iniciačného komplexu počas procesu transkripcie. Vyskytujú sa takmer vo všetkých eukaryotoch a v prokaryotoch tvoria menej komplikovaný komplex. Špecifické transkripčné faktory sú buď zosilňovače alebo represory, čo sú špecifické sekvencie DNA, ktoré aktivujú alebo potláčajú všeobecný transkripčný proces. Niektoré špecifické transkripčné faktory môžu zmeniť samotnú sekvenciu DNA. kľúčový rozdiel medzi všeobecnými transkripčnými faktormi a špecifickými transkripčnými faktormi je založená na funkčnosti. Všeobecné transkripčné faktory sa podieľajú na tvorbe preinicializačného komplexu transkripčného procesu, zatiaľ čo špecifické transkripčné faktory sa podieľajú na aktivácii alebo potlačení transkripčného procesu..

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo sú všeobecné transkripčné faktory
3. Čo sú špecifické transkripčné faktory
4. Podobnosti medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi
5. Porovnanie vedľa seba - všeobecné vs. špecifické transkripčné faktory v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo sú všeobecné transkripčné faktory?

Všeobecné alebo Bazálne transkripčné faktory sú faktory, ktoré sa podieľajú na tvorbe iniciačného komplexu počas transkripcie. Sú nevyhnutné pre proces transkripcie, a preto zohrávajú dôležitú úlohu pri úspešnej transkripcii. Existuje šesť kľúčových všeobecných transkripčných faktorov. Oni sú; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF a TFIIA. Pri formovaní iniciačného komplexu hrajú rôzne úlohy.

1. triedy - Tento transkripčný faktor (TF) sa podieľa na rozpoznávaní promótorovej sekvencie (TATA box).
2. TFIIB - Komplex promótor / TFIID je rozpoznávaný TFIIB. To poskytuje signál na väzbu hlavného katalyzujúceho enzýmu RNA polymerázy.
3. TFIIF - Tento transkripčný faktor je naviazaný na RNA polymerázu. TFIIF sa teda zúčastňuje na procese získavaním RNA polymerázy na správne miesto.
4. tri a TFIIH - Väzba týchto transkripčných faktorov značí koniec tvorby pred-iniciačnej väzby. Väzba týchto transkripčných faktorov zvyšuje účinnosť tvorby pred-iniciačného komplexu..
5. tri podporuje väzbu TFIID na TATA box.

Obrázok 01: Všeobecné transkripčné faktory

Vyššie uvedené všeobecné transkripčné faktory sú špecifické pre RNA polymerázu II, ktorá je typom RNA polymerázy, ktorá predlžuje reťazec mRNA. S RNA polymerázou I a III sa vyskytujú všeobecné transkripčné faktory. Všeobecné transkripčné faktory sa tiež môžu líšiť v závislosti od typu bunky, na ktorú pôsobí.

Čo sú špecifické transkripčné faktory?

Špecifické transkripčné faktory sú oblasti, ktoré sa nachádzajú aj v sekvenciách DNA. Väčšinou ide o zosilňovače alebo represory. Špecifické transkripčné faktory sú špecifické cis-pôsobiace prvky v templátovom reťazci DNA, ktoré sa podrobujú transkripcii. Aktivácia týchto špecifických zosilňovačov a represorov sa podieľa na zvýšení afinity enzýmu zmenou orientácie molekuly DNA alebo pôsobením ako signálne oblasti. Špecifické transkripčné faktory sa tiež používajú na vyvolanie modifikácií vlákna templátu DNA. Tieto modifikácie zahŕňajú najmä kovalentné modifikácie, ako je metylácia. Metylované oblasti DNA teda pôsobia ako špeciálne zosilňovače alebo represory transkripčného procesu.

Obrázok 02: Špecifické transkripčné faktory

Špecifické transkripčné faktory závisia od druhu a vo všetkých eukaryotoch sa bežne nenachádzajú. Tieto transkripčné faktory sú aktivované rôznymi metabolickými podmienkami prostredníctvom signálnych transdukčných dráh. Po aktivácii regulujú expresiu génu na transkripčnej úrovni.

Aké sú podobnosti medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi?

• Pri transkripcii sú potrebné oba faktory.
• Oba faktory ovplyvňujú génovú expresiu organizmu.
• Oba faktory pomáhajú regulovať funkciu RNA polymerázy v transkripčnom procese.
• Oba faktory sa vyskytujú väčšinou v eukaryotoch.

Aký je rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi?

Všeobecný verzus špecifický prepis
Všeobecné transkripčné faktory sú faktory, ktoré sa používajú na vytvorenie pred iniciačného komplexu počas procesu transkripcie.	Špecifické transkripčné faktory sú buď zosilňovače alebo represory, čo sú špecifické sekvencie DNA, ktoré aktivujú alebo potláčajú všeobecný transkripčný proces..
Typ molekuly
Všeobecné transkripčné faktory sú založené na proteínoch.	Špecifické transkripčné faktory sú nukleotidové sekvencie.
Tvorenie
Všeobecné transkripčné faktory tvoria pred-iniciačný komplex počas iniciácie transkripcie.	Špecifické transkripčné faktory pôsobia ako zosilňovače alebo represory transkripcie.
druhy
Existuje šesť hlavných typov; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE a TFIIA všeobecných transkripčných faktorov.	Konkrétne transkripčné faktory sa kategorizujú hlavne ako zosilňovače a represory.

Zhrnutie - Všeobecné vs špecifické transkripčné faktory

Faktory transkripcie sú nevyhnutné pre reguláciu transkripcie a sú potrebné na zvýšenie účinnosti a presnosti procesu. Faktory transkripcie sú dva hlavné typy; Všeobecné / základné a špecifické. Všeobecné transkripčné faktory sa podieľajú na tvorbe komplexu pre iniciáciu počas transkripcie, zatiaľ čo špecifické transkripčné faktory sú oblasti v samotnej DNA, ktoré pôsobia ako zosilňovače alebo represory. Všeobecné transkripčné faktory sú založené na proteínoch a vyžadujú všetky eukaryoty. Nie je to veľmi rozmanité a zostáva ako jednotné molekuly. Špecifický transkripčný faktor sa môže značne líšiť a závisí od genetického zloženia jednotlivca. Toto je rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi.

Stiahnite si verziu PDF s všeobecnými verziami špecifických transkripčných faktorov

Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ju na účely offline podľa citácie. Stiahnite si verziu PDF tu Rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi

referencie:

1.Pulverer, Bernd. „Transkripčné faktory špecifické pre DNA-väzbové transkripčné faktory.“ Nature News, Nature Publishing Group. K dispozícii tu 
2. „Faktory transkripcie - faktory špecifické pre gény odlišne zvyšujú mieru transkripcie.“ DNA, väzba, promotér a väzba - články JRank. K dispozícii tu  
3.Orphanides, G, et al. "Všeobecné transkripčné faktory RNA polymerázy II." Genes & Development, Cold Spring Harbor Lab. K dispozícii tu  

S láskavým dovolením:

1.'Preiniciačný komplex 'Autor: ArneLH - Vlastná práca, (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia  
2. „Úloha transkripčného faktora v regulácii génovej expresie“ Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computational System Biology of Cancer Chapman & Hall / CRC Mathematical & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia