Rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom

kľúčový rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom je to haploskupina označuje skupinu podobných haplotypov, ktoré zdieľajú spoločného predka, zatiaľ čo haplotyp označuje skupinu alel zdedených po generácii z generácie na genetickú väzbu.

Gén pozostáva predovšetkým z dvoch alel. V chromozómoch sú prítomné tisíce génov. Pri segregácii vykazujú prechody a genetické rekombinácie. Niektoré alely génov sú však umiestnené veľmi blízko seba. Jednoducho povedané, tieto alely vykazujú genetickú väzbu. Preto nie je pravdepodobné, že dôjde k kríženiu alebo k rekombinácii. Namiesto toho majú vždy tendenciu prenášať spolu z generácie na generáciu. V súlade s tým je haplotyp kombináciou alel alebo skupiny jednoduchých nukleotidových polymorfizmov prítomných na rovnakom chromozóme, ktoré sú dedené spolu po generáciách od jedného rodiča. Haploskupina je skupina podobných haplotypov, ktoré zdieľajú spoločného predka.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to Haploskupina 
3. Čo je to haplotyp
4. Podobnosti medzi haploskupinou a haplotypom
5. Porovnanie bok po boku - Haploskupina vs. haplotyp v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je to Haploskupina?

Haploskupina je skupina podobných haplotypov, ktoré zdieľajú spoločného predka. Inými slovami, haploskupina je kombináciou alel prítomných v rôznych chromozómoch, ktoré sa zdedia spolu. Tieto alely sú prítomné veľmi blízko pri sebe. Haplotypy v haploskupine majú podobné vzorce a sú príbuznými potomkami, pretože majú spoločného predka. Je teda ľahké predpovedať haploskupinu z haplotypov.

Obrázok 01: Haploskupina

U človeka existujú dve najbežnejšie haploskupiny. Sú to chromozómové haploskupiny, ktoré prechádzajú z otca na syna, zatiaľ čo mitochondriálne haploskupiny, ktoré prechádzajú z matky na dcéru alebo syna.

Čo je to Haplotyp?

Haplotyp je skupina alel zdedených spolu. Tieto alely sú prítomné v rovnakom chromozóme veľmi blízko pri sebe kvôli genetickej väzbe. Preto neexistuje žiadna šanca na rekombináciu alebo kríženie. Preto prechádzajú z generácie na generáciu. Tieto alely môžu byť alely jedného génu alebo alely naprieč viacerými génmi. Haplotyp sa môže vzťahovať aj na zhluky jednoduchých nukleotidových polymorfizmov prítomných na rovnakom chromozóme. Sú teda súborom variácií DNA alebo polymorfizmov zdedených spolu.

Obrázok 02: Jednoduchý nukleotidový polymorfizmus

Informácie o haplotypoch sú užitočné pri skúmaní vplyvu génov na choroby. Analýzou haplotypov a haplotypových stromov môžu genetici detegovať oblasti genómu súvisiace s chorobou a určiť vzorce genetickej variácie súvisiace s chorobami. Okrem toho sú užitočné pri mapovaní génov pri umiestňovaní genetických markerov na správne miesta na chromozómy.

Aké sú podobnosti medzi haploskupinou a haplotypom?

• Haploskupina pozostáva z podobných haplotypov.
• Vykazujú genetické väzby.
• V haplotypoch a haploskupinách chýba kríženie alebo genetická rekombinácia.

Aký je rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom?

Haploskupina je kombináciou aliel prítomných v rôznych chromozómoch, ktoré sú dedené spolu. Pozostáva z podobných haplotypov zdieľajúcich spoločného predka. Na druhej strane haplotyp je skupina alel nachádzajúcich sa v rovnakom chromozóme, ktoré sa dedia po generácie. Toto je kľúčový rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom.

Nižšie uvedený infographic sumarizuje rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom.

Zhrnutie - Haploskupina vs Haplotyp

Haploskupina je skupina podobných haplotypov, ktoré zdieľajú spoločného predka. Na druhej strane haplotyp je kombináciou alel alebo skupiny jednoduchých nukleotidových polymorfizmov prítomných na rovnakom chromozóme, ktoré sa prenášajú generáciami od jedného rodiča. Preto je to hlavný rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom. Haplotypy poskytujú ľahký spôsob predpovedania haploskupín, pretože haploskupina pozostáva z podobných haplotypov..

referencie:

1. „Haplotyp“. Genome.gov, k dispozícii tu.
2. „Haploskupina“. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8. júla 2019, k dispozícii tu.

S láskavým dovolením:

1. „Molekulárna línia“ Wobble - vlastná práca (public domain) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Dna-SNP“ Autorom modelu SNP je David Eccles (gringer) (CC BY 4.0) prostredníctvom Commons Wikimedia.