Rozdiel medzi vkladacími a náhradnými vektormi

kľúčový rozdiel medzi inzerčnými a substitučnými vektormi je to, že inzerčný vektor má schopnosť vložiť stredne dlhé cudzorodé DNA, zatiaľ čo náhradný vektor je schopný pojať väčšie dĺžky cudzej DNA..

Fágové vektory sú bakteriofágy používané na klonovanie. Existujú dva typy fágových vektorov; sú inzerčným vektorom a náhradným vektorom. Všetky fágové vektory tiež pozostávajú z nepodstatných génov. Tieto gény sa však musia odstrániť z fágov, aby sa uľahčili nové inzerty cudzej DNA.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo sú vkladacie vektory
3. Čo sú náhradné vektory
4. Podobnosti medzi vkladacími a náhradnými vektormi
5. Porovnanie vedľa seba - Vkladanie vs Náhradné vektory v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je vkladací vektor?

V prvom rade je inzerčný vektor najjednoduchšou formou klonovacích vektorov lambda. V skutočnosti je to typ fágového vektora, ktorý má jedinečné reštrikčné miesto zavedené do vektorového genómu v pozícii voliteľnej DNA. Fágová DNA ďalej zostáva bez odstránenia. Toto neodstránenie fágovej DNA obmedzuje veľkosť inzertov (cudzej DNA), ktoré sa majú klonovať vo vektore. Tieto vektory sú navyše užitočné pri klonovaní a expresii cDNA. GT10, GT11 a Zap sú príklady tohto vektora.

Obrázok 01: Lambda fág

Vkladací vektor pozostáva z jedného rozpoznávacieho miesta. Primárnou funkciou tohto vektora je vývoj cDNA knižníc odvodených z eukaryotických mRNA sekvencií. Okrem toho môže pojať iba dĺžky cudzej DNA v rozsahu medzi 05-11 kb. Tiež má jedinečné miesto štiepenia na inzerciu cudzej DNA.

Čo sú náhradné vektory?

Nahradný vektor alebo substitučný vektor je typ fágového vektora, ktorý sa vyvinul odstránením strednej časti fragmentu fágovej DNA z oblasti „výplne“. Požadovaný inzert cudzej DNA nahrádza fágovú DNA.

Obrázok 02: Náhradný vektor

Náhradné vektory sú dôležité pri vytváraní genomických knižníc, ako sú EMBL4 a Charon40. Tieto vektory môžu pojať väčšiu dĺžku cudzej DNA v rozsahu medzi 08-24 kb. Výplňová oblasť tiež pozostáva z génu, ktorý robí fágový vektor neživotaschopným vnútri bakteriálneho hostiteľa.

Aké sú podobnosti medzi vektormi vloženia a nahradenia?

• Vkladacie a náhradné vektory sú fágové vektory.
• Oba vektory prijímajú inzerty cudzej DNA.
• Obaja sú nápomocní pri vytváraní knižníc DNA.

Aký je rozdiel medzi vektormi vloženia a nahradenia?

Vloženie vs náhradné vektory
Vkladací vektor je typ fágového vektora, ktorý má reštrikčné miesto zavedené do fágového genómu v mieste voliteľnej DNA..	Náhradný vektor je typ fágového vektora, ktorý sa vyvinul odstránením strednej oblasti výplne fragmentu fágovej DNA
Veľkosť vložených fragmentov
Dĺžka 05 až 11 kb	Dĺžka 08 až 24 kb
Výplňový fragment
Žiadny fragment výplne	Výplňový fragment sa nahradí cudzou vložkou
funkcie
Dôležité je vytvoriť knižnice cDNA	Dôležité pri vytváraní knižníc genómu
Príklady
GT10, GT11 a Zap sú príklady	EMBL4 a Charon40 sú príklady
Štiepne miesto
Je prítomné jedinečné miesto štiepenia	Miesto štiepenia obsahuje gény, ktoré nie sú nevyhnutné pre lytický cyklus

Zhrnutie - vkladanie vs náhradné vektory

Vkladací aj náhradný vektor sú dva typy fágových vektorov. Oba vektory majú reštrikčné miesta, ktoré uľahčujú umiestnenie nových inzertov cudzej DNA. Vkladacie vektory sú dôležité pri vytváraní knižníc cDNA, zatiaľ čo náhradné vektory sú dôležité pri vytváraní genomických knižníc. Inštalačné vektory okrem toho prijímajú inzerty DNA so strednou dĺžkou. Ale náhradné vektory môžu pojať väčšie dĺžky inzertov cudzej DNA. Celkovo je to kľúčový rozdiel medzi inzerčnými a náhradnými vektormi.

referencie:

1. Hasty, P, a kol. „Účinnosť inzercie verzus nahradenie vektorového zacielenia sa líši v rôznych chromozomálnych lokusoch.“ Molecular and Cellular Biology, U.S. National Library of Medicine, december 1994, k dispozícii tu.
2. „Vkladacie vektory Lambda.“ Biology 335 Notes Lecture Notes - Lambda Vectors, k dispozícii tu.
3. „Náhradný vektor“. Náhradný vektor - Terminológia molekulárnej biológie pre náhradný vektor - GenScript, k dispozícii tu.

S láskavým dovolením:

1. „Lambda fág“ od Lizanne Koch - vlastná práca s ChemBioDraw (public domain) cez Commons Wikimedia