Rozdiel medzi motívom a doménou

kľúčový rozdiel medzi motívom a doménou je to motív nie je nezávisle stabilný, zatiaľ čo doména je nezávisle stabilná.

Bielkoviny sú dôležité biologické makromolekuly prítomné v našom tele. Na druhej strane genetický kód génu rozhodne o aminokyselinovej sekvencii proteínu. Proteíny majú navyše primárne, sekundárne a terciárne štruktúry. Primárna štruktúra je aminokyselinová sekvencia polypeptidového reťazca. Keď sa polypeptidové reťazce navzájom skladajú, tvoria sekundárnu štruktúru proteínu. K sekundárnym štruktúram patria alfa helixy, beta listy a super-sekundárne štruktúry. Niektoré zoskupenia super-sekundárnych prvkov sú známe ako proteínové motívy. Terciárna štruktúra proteínu sa týka jeho trojrozmernej štruktúry, ktorá rozhoduje o funkcii proteínu. Doména je zložená časť proteínovej molekuly, ktorá je guľovitá a má diskrétnu funkciu. Je to základná funkčná a trojrozmerná štruktúra proteínu.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je motív
3. Čo je doména
4. Podobnosti medzi motívom a doménou
5. Porovnanie bok po boku - motív vs doména v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je motív?

Motív je určité zoskupenie super sekundárnych prvkov proteínov, ako sú alfa helixy a beta štruktúry. Sú to nejaké vzory prítomné v rôznych proteínoch. Motívy opisujú vzory skladania sekundárnych štruktúrnych prvkov a ich vzájomné pôsobenie. Tieto vzory skladania sa stabilizujú podobnými väzbami, ktoré sú prítomné v terciárnych štruktúrach. Nie sú však také zložité ako terciárne štruktúry.

Obrázok 01: Motív

Sú to jednoduché kombinácie sekundárnych štruktúr proteínov. Samotný motív nie je stabilný. Okrem toho motívy vysvetľujú štruktúru proteínu, ale nepredpovedajú funkciu proteínu. Príkladmi proteínových motívov sú motív beta-alfa-beta, grécky kľúčový motív, betónový valec, motív beta-meandrov atď..

Čo je doména?

Doména je základná, funkčná a trojrozmerná jednotka proteínu. Vykonáva konkrétnu funkciu. Jeden proteín môže mať niekoľko odlišných domén. Každá doména je nezávislá jednotka. Je to globulárna štruktúra. Je zodpovedný za konkrétnu funkciu alebo interakciu. Domény sa môžu použiť na hypotézu funkcie necharakterizovaného proteínu. Pri analýze proteínu je nevyhnutné vziať do úvahy, pretože domény sú funkčnými jednotkami proteínu.

Obrázok 02: Tri rôzne domény pyruvátkinázy

Domény sú veľmi stabilné a kompaktné štruktúry. Dajú sa ľahko odlíšiť od ostatných regiónov. Pyruvátkináza má tri rozličné domény, ako je znázornené na obrázku 02. Dĺžka domény sa môže meniť a priemerná dĺžka je 100 aminokyselín. Každá doména obsahuje hydrofóbne jadro vyrobené zo sekundárnych štruktúrnych jednotiek. Niekoľko domén spoločne vytvára terciárnu štruktúru proteínu.

Aké sú podobnosti medzi motívom a doménou?

• Motív a doména sú jednotky prítomné v samotných proteínových molekulách.
• Sú užitočné pri klasifikácii proteínových rodín.

Aký je rozdiel medzi motívom a doménou?

Motív je určité zoskupenie super sekundárnych prvkov proteínov, ako sú alfa helixy a beta štruktúry, zatiaľ čo doména je funkčnou jednotkou proteínu. Okrem toho je motív sekundárna štruktúra, zatiaľ čo doména je zodpovedná za terciárnu štruktúru proteínu. Doména je navyše na rozdiel od motívu nezávislou jednotkou. Doména tiež zobrazuje funkciu proteínu, zatiaľ čo motív nie je. Toto sú hlavné rozdiely medzi motívom a doménou. Nižšie uvedený infographic predstavuje rozdiel medzi motívom a doménou v tabuľkovej forme.

Zhrnutie - Motif vs Domain

Motív je usporiadanie sekundárnych štruktúr proteínovej molekuly. Na rozdiel od domény zvyčajne nie je sám o sebe stabilný. Doména je nezávisle stabilná štruktúra proteínu. Preto môže ísť o časť alebo celú proteínovú molekulu. Je to trojrozmerná základná funkčná jednotka proteínu. Okrem toho má funkciu a je nezávislou jednotkou. Motív môže byť súčasťou domény. Doména však nemôže byť súčasťou motívu. Toto je rozdiel medzi motívom a doménou.

referencie:

1. „Proteínová doména“. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. júla 2018. K dispozícii tu

S láskavým dovolením:

1. "Kľúčový motív bielkovín toxínu antraxu" Autor: NatelewisDerivatívne práce (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Proteíny proteínov pyruvát kinázy“ Thomas Splettstoesser - Vlastná práca (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia