Nukleotidy sú základné štruktúrne jednotky, ktoré syntetizujú komplexné polymérne formy DNA (nukleová kyselina deoxyribóza) a RNA (nukleová kyselina ribóza). Nukleotidy sú organické molekuly. Skladajú sa z troch základných podjednotiek: dusíkatá báza, pentózový cukor (ribóza / deoxyribóza) a fosfátová skupina. DNA a RNA syntetizovaná z nukleotidov pôsobia ako základné biomolekuly v živom systéme. Existuje mnoho typov nukleotidov, vrátane oligonukleotidov a polynukleotidov. Oligonukleotidy sú krátke segmenty DNA a RNA s jedným alebo viacerými nukleotidovými monomérmi zatiaľ čo polynukleotidy sú biopolyméry s 13 alebo viac nukleotidovými monomérmi. Toto je kľúčový rozdiel medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi.
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to oligonukleotid
3. Čo je to polynukleotid
4. Podobnosti medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi
5. Porovnanie vedľa seba - oligonukleotid verzus polynukleotid v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie
Krátke segmenty molekúl DNA a RNA sú známe ako oligonukleotidy. Často sa používajú v oblasti forenznej vedy, genetiky a výskumu. Oligonukleotidy sa môžu vyrábať procesom známym ako chemická syntéza na pevnej fáze v laboratóriu. Vyrábajú sa ako jednovláknové molekuly so sekvenciou, ktorá je špecifikovaná pre konkrétnu funkciu a je dôležitým aspektom v kontexte PCR (polymerázová reťazová reakcia), DNA microarrays, techniky Southern blot, FISH (fluorescenčná in situ hybridizácia), syntézy umelé gény, produkcia DNA / RNA knižníc a pôsobia ako molekulárne sondy.
Obrázok 01: Oligonukleotid
Oligonukleotidy sa prirodzene vyskytujú ako mikroRNA, malé molekuly RNA, ktoré regulujú génovú expresiu. Oligonukleotidy môžu byť tiež prítomné kvôli katabolizmu väčších nukleových kyselín. Celá molekula je charakterizovaná a vyvinutá sekvenciou nukleotidových zvyškov. Oligonukleotidy zložené z fragmentov DNA sa používajú pri PCR, čo je postup, pri ktorom by sa malé množstvo DNA mohlo amplifikovať do miliónov kópií. Oligonukleotidy tu pôsobia ako priméry, ktoré pomáhajú pri fungovaní DNA polymerázy. Chemicky alebo prírodne modifikovaný nukleozid známy ako fosforamidit pôsobí ako hlavná zložka pri syntéze oligonukleotidov. Syntéza oligonukleotidového vlákna prebieha od 3 'konca do 5' konca v cyklickej ceste označovanej ako syntetický cyklus. Po dokončení jedného syntetického cyklu sa do rastúceho reťazca pridá jeden nukleotid.
Polynukleotidová molekula pozostáva z 13 alebo viacerých nukleotidových monomérov a označuje sa ako biopolymér. Monoméry sú kovalentne naviazané na nukleotidový reťazec. DNA a RNA sú príklady polynukleotidov. Najjednoduchším polynukleotidom v živom systéme je RNA (ribonukleová kyselina), ktorá obsahuje pentózový cukor ribóza. RNA je zložená z jednovláknového polynukleotidu. Molekula sa skladá zo štyroch dusíkatých báz, adenínu, guanínu, cytozínu a uracilu. RNA je mnohých rôznych typov: mRNA (messengerová RNA), rRNA (ribozomálna RNA), tRNA (prenosová RNA).
Nukleová kyselina deoxyribózy (DNA) je ďalší polynukleotid, ktorý pozostáva z pentózového cukru deoxyribózy. Dusíkaté bázy sú adenín, guanín, tymín a cytozín a sú zložené z dvoch špirálovito usporiadaných polynukleotidových reťazcov. Adenínový pár s tymínom a guanínový pár s cytozínom. Toto sa označuje ako doplnkové párovanie báz.
Obrázok 02: Polynukleotid
Polynukleotidy, DNA aj RNA, sa prirodzene vyskytujú v živých organizmoch a používajú sa pri pokusoch biologických aj biochemických. Polynukleotidy sa používajú pri PCR a DNA sekvenovaní. Môžu sa syntetizovať umelo pomocou oligonukleotidov. Na syntézu a predĺženie polynukleotidového vlákna sa pridajú nové nukleotidy a reťazec sa predĺži prítomnosťou enzýmov polymerázy..
Oligonukleotid verzus polynukleotid | |
Oligonukleotid je fragment DNA alebo RNA, ktorý sa skladá z jedného alebo viacerých nukleotidových monomérov. | Polynukleotid je biopolymér, ktorý sa skladá z 13 alebo viacerých nukleotidových monomérov. |
veľkosť | |
Oligonukleotid je kratší ako polynukleotid. | Polynukleotid je dlhší ako oligonukleotid. |
funkcie | |
Oligonukleotidy sa používajú v genetických technikách, ako je FISH. PCR, micro micro array. | Polynukleotidy sa používajú pri FISH, PCR, sekvenovaní DNA atď. |
Nukleotidy sú dôležité biomolekuly, ktoré sa podieľajú na hlavných metabolických funkciách v živých systémoch. Sú to monoméry DNA aj RNA. Nukleotidy sú organické molekuly a sú zložené z troch základných podjednotiek: dusíkatá báza, pentózový cukor a fosfátová skupina. Oligonukleotidy a polynukleotidy sú dva dôležité typy nukleotidov. Obe molekuly sa používajú v rôznych genetických technikách vrátane FISH a PCR. Oligonukleotidy sa skladajú z jedného alebo viacerých nukleotidových monomérov, zatiaľ čo polynukleotidy sa skladajú z 13 alebo viacerých nukleotidových monomérov. Oligonukleotidy sú kratšie ako polynukleotidy. Toto je rozdiel medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi.
Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ju na účely offline podľa citácie. Stiahnite si verziu PDF tu Rozdiel medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi
1. Ohtsuka, E, a kol. „Posledný vývoj v chemickej syntéze polynukleotidov.“ Nucleic Acids Research, US National Library of Medicine, 11. novembra 1982, k dispozícii tu. Prístup k 31. augustu 2017.
2. Mandal, MD Dr Ananya. "Čo je to oligonukleotid?" News-Medical.net, 10. september 2014, k dispozícii tu. Prístup k 31. augustu 2017
1. „Antisense DNA oligonukleotid“ od spoločnosti Robinson R - RNAi Therapeutics: Aká pravdepodobná, ako skoro? Robinson R PLoS Biology Zv. 2, č. 1, dostupné tu (CC BY 2.5) na Commons Wikimedia
2. „Štruktúra DNA + kľúč + označený.pn NoBB“ od Zephyris - vlastná práca (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia