Peptid verzus proteín
Aminokyseliny, peptidy a proteíny sa často označujú ako príbuzné termíny, napriek tomu sa líšia svojimi charakteristikami. Aminokyseliny sú stavebnými kameňmi peptidov aj proteínov. Aminokyselina je malá molekula, ktorá obsahuje aminoskupinu (-NH)2) a skupinu karboxylovej kyseliny (-COOH), ktorá je naviazaná na centrálny atóm uhlíka, s ďalším vodíkom a bočným reťazcom (skupina R-). Tento bočný reťazec sa medzi všetkými aminokyselinami líši; preto určuje jedinečné znaky a chémiu každej aminokyseliny. Konkrétna génová sekvencia sa používa na stanovenie aminokyselinovej sekvencie peptidov aj proteínov.
peptid
Peptidy sú pripravené z dvoch alebo viacerých aminokyselín, spojených peptidovými väzbami a sú prítomné ako lineárne reťazce. Dĺžka peptidu je určená množstvom aminokyselín v ňom. Dĺžka peptidu je obvykle menšia ako približne 100 aminokyselín.
Predpony sa používajú na opis typu peptidov vo všeobecnej terminológii. Napríklad, keď je peptid vyrobený z dvoch aminokyselín, nazýva sa dipeptid. Podobne sa tri aminokyseliny kombinujú za vzniku tripeptidov, štyri aminokyseliny sa kombinujú za vzniku tetrapeptidov atď. Okrem týchto typov existujú oligopeptidy (tvorené 2 až 20 aminokyselinami) a polypeptidy, ktoré majú veľa peptidov (menej ako 100). Najdôležitejšie charakteristické znaky peptidov sú určené množstvom a sekvenciou aminokyselín.
Primárnou funkciou väčšiny peptidov je umožniť účinnú komunikáciu prenášaním biochemických správ z jedného miesta na druhé v tele.
proteín
Bielkoviny sú najrozmanitejšou skupinou biologických makromolekúl. Proteín je zložený z jedného alebo viacerých dlhých nerozvetvených reťazcov nazývaných polypeptidy a stavebnými blokmi proteínov sú aminokyseliny. Sekvencia aminokyseliny určuje hlavné charakteristiky proteínu, zatiaľ čo táto aminokyselinová sekvencia je definovaná konkrétnou génovou sekvenciou.
Proteiny majú obvykle stabilné trojrozmerné štruktúry. O týchto štruktúrach sa dá diskutovať z hľadiska hierarchie štyroch úrovní; primárne, sekundárne, terciárne a kvartérne. Primárna štruktúra je aminokyselinová sekvencia proteínu. Sekundárna štruktúra sa vytvára tvorbou vodíkových väzieb medzi dvoma blízkymi aminokyselinami, čím sa získajú štruktúry nazývané p-plátované listy a cievky nazývané a-helixy. Oblasti sekundárnej štruktúry sa potom prehnú ďalej v priestore, aby sa vytvorili konečné trojrozmerné štruktúry proteínu. Usporiadanie viacerých polypeptidov v priestore vedie ku kvartérnej štruktúre proteínu.
Hlavnými funkciami proteínov sú enzýmová katalýza, obrana, transport, podpora, pohyb, regulácia a skladovanie.
Aký je rozdiel medzi peptidom a proteínom?
• Peptidy sú krátke lineárne reťazce aminokyselín, zatiaľ čo proteíny sú veľmi dlhé reťazce aminokyselín.
• Niekoľko aminokyselín je spojených peptidom pomocou peptidových väzieb, zatiaľ čo niekoľko peptidov je spojených dohromady za vzniku proteínových molekúl.
• Normálne majú proteíny stabilné trojrozmerné štruktúry. Naopak peptidy nie sú usporiadané do stabilnej trojrozmernej štruktúry.
• Dĺžka peptidu je menej ako približne 100 aminokyselín, zatiaľ čo dĺžka proteínu je viac ako 100 aminokyselín. (Existujú výnimky; rozdiely sa preto spoliehajú skôr na funkciu molekúl, nie na ich veľkosť)
• Na rozdiel od peptidov sa proteíny považujú za makromolekuly.
• V peptidoch tvoria vodíkové väzby iba bočné reťazce aminokyselín. Zatiaľ čo v proteínoch tvoria vodíkové väzby nielen bočné reťazce, ale aj peptidové skupiny. Tieto vodíkové väzby môžu byť s vodou alebo s inými peptidovými skupinami.
• Všetky peptidy existujú ako lineárne reťazce, zatiaľ čo proteíny môžu existovať ako primárne, sekundárne, terciárne a kvartérne.