Rozdiel medzi plazmidom a transpozónom

Kľúčový rozdiel - Plazmid verzus Transpozón
 

Baktérie obsahujú chromozomálnu a nechromozomálnu DNA. Chromozomálna DNA hrá dôležitú úlohu v raste baktérií. Chromozomálna DNA nekóduje esenciálne gény pre bakteriálne prežitie. Plazmid je typ prokaryotickej nechromozomálnej DNA. Sú to malé cirkulárne dvojreťazcové DNA, ktoré baktériám poskytujú ďalšie genetické výhody. Transpozón je sekvencia DNA, ktorá sa môže presunúť do nových pozícií v genóme. Sú známe aj ako mobilný genetický materiál baktérií. Kľúčový rozdiel medzi plazmidom a transpozónom je ten Plazmid je nechromozomálna DNA, ktorá sa replikuje nezávisle v baktérii zatiaľ čo transpozón je segment chromozomálnej DNA, ktorý sa translokuje v genóme baktérií a mení genetickú sekvenciu chromozómu.

OBSAH
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je plazmid
3. Čo je Transposon
4. Porovnanie vedľa seba - Plazmid verzus Transpozón
5. Zhrnutie

Čo je plazmid?

Plazmid je extrachromozomálna DNA prokaryotov. Môže sa replikovať nezávisle od bakteriálneho chromozómu. Jedna baktéria môže mať vo vnútri niekoľko plazmidov. Plazmidy sú uzavreté kruhové kúsky DNA a sú malé. Plazmidová DNA obsahuje niekoľko génov, ktoré nie sú nevyhnutné na prežitie baktérie. Tieto gény v plazmidoch však poskytujú ďalšie genetické výhody pre baktérie, ako napríklad rezistencia voči antibiotikám, rezistencia na herbicídy, tolerancia voči ťažkým kovom, atď..

Plazmidy sa používajú ako vektory v technológii rekombinantnej DNA a klonovaní génov. Plazmidy majú špeciálne vlastnosti, vďaka ktorým sú vhodné na použitie ako rekombinantné vektory v genetickom inžinierstve. Obsahujú počiatok replikácie, selekčné markérové ​​gény, dvojreťazcový charakter, malé veľkosti a viac klonovacích miest. Vedci môžu ľahko otvoriť plazmidovú DNA a vložiť požadované fragmenty alebo gény DNA do plazmidov, aby vytvorili rekombinantnú DNA. Okrem toho je transformácia rekombinantného plazmidu na hostiteľskú baktériu ľahšia ako iné vektory.

Obrázok 01: Plazmidy

Čo je Transpozón?

Transpozón je fragment alebo sekvencia DNA, ktorá sa môže translokovať v bakteriálnom genóme. Sú to mobilné DNA sekvencie. Pohybujú sa na nových miestach genómu. Tieto pohyby robia zmeny v sekvencii bakteriálneho genómu, čo spôsobuje významné zmeny v genetickej informácii. Sú to transponovateľné genetické prvky zodpovedné za stanovenie nových genetických sekvencií v baktériách. Transpozóny prvýkrát objavila Barbara McClintock v 40. rokoch minulého storočia experimentami s kukuricou a za svoju prácu získala Nobelovu cenu..

Transpozóny sa niekedy označujú ako skákajúce gény, pretože tieto skákacie sekvencie môžu blokovať transkripciu génov a preskupiť genetický materiál baktérie. Sú tiež zodpovedné za pohyb génov rezistencie voči antibiotikám, génov rezistencie na antibiotiká medzi plazmidmi a chromozómami.

Existujú dva typy transpozónov na základe mechanizmu, ktorý používajú na pohyb a vkladanie. Oni sú transpozón triedy I (retrotranspozóny) a transpozón triedy II (DNA transpozóny). Transpozóny triedy I používajú mechanizmus „kopírovania a vkladania“, zatiaľ čo transpozóny triedy II používajú „mechanizmus vyberania a vkladania“.

Transpozón sa môže pohybovať z plazmidu do chromozómu alebo medzi dvoma plazmidmi. Vďaka týmto pohybom sú gény zmiešané medzi bakteriálnymi druhmi. Preto sa transpozóny používajú ako vektory v genetickom inžinierstve na odstránenie a integráciu genetických sekvencií do organizmov.

Obrázok 02: Bakteriálny DNA transpozón

Aký je rozdiel medzi Plazmidom a Transposonom?

Plazmid verzus Transposon
Plazmid je malá cirkulárna dvojreťazcová ne-chromozomálna DNA baktérií.	Transpozón je segment DNA, ktorý sa dokáže presúvať na nové miesta v genóme.
Self-Replication
Plazmidy sa dokážu replikovať nezávisle od chromozomálnej DNA.	Transpozóny sa nemôžu replikovať nezávisle.
Kódované špeciálne vlastnosti
Plazmidy poskytujú niekoľko funkcií, ako je rezistencia na antibiotiká a virulencia.	Transpozóny nekódujú špeciálne znaky.
Použitie ako vektor
Plazmidy sa používajú ako vektory v genetickom inžinierstve na výrobu rekombinantnej DNA.	Transpozóny sa tiež používajú ako vektory v genetickom inžinierstve na inzerčnú mutagenézu.
Mutácie a zmeny v sekvencii
Plazmidy nie sú schopné spôsobiť významné mutácie a meniť sekvenciu a veľkosť genómu.	Transpozícia môže spôsobiť významné mutácie a zmeniť sekvenciu a veľkosť genómu.

Zhrnutie - Plasmid vs Transposon

Plazmid je extrachromozomálna DNA bežne sa vyskytujúca v baktériách. Má schopnosť sa replikovať nezávisle od bakteriálnej chromozomálnej DNA. Plazmidy obsahujú gény, ktoré bakteriám dodávajú genetické výhody. Plazmidová DNA však nie je nevyhnutná na prežitie baktérií. Transpozóny sú mobilné genetické prvky, ktoré skočia z jedného miesta na nové miesto v genóme. Sú schopní spôsobiť mutácie a zmeniť veľkosť a sekvenciu genómu. Toto je rozdiel medzi plazmidom a transpozónom.

referencie:
1. Griffiths, Anthony JF. "Prokaryotické transpozóny." Úvod do genetickej analýzy. 7. vydanie. U.S. National Library of Medicine, 1. januára 1970. Web. 26. apríla 2017
2. „Epizómy, plazmidy, inzertné sekvencie a transpozície.“ Svet mikrobiológie a imunológie. Encyklopédia.com, n.d. Web. 27. apríla 2017

S láskavým dovolením:
1. „Plazmid (anglický)“ Autor: Spaully on English wikipedia - Vlastné dielo (CC BY-SA 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Kompozitný transpozón“ Autor: Jacek FH - vytvorený na základe obrázka: Kompozitný transposon.jpg (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia