Rozdiel medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením

kľúčový rozdiel medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením je termin v Rho závislé zakončenie, Rho faktor sa viaže s transkriptom a ukončí transkripciu prerušením vodíkových väzieb medzi templátom a transkriptom, zatiaľ čo Rho nezávislé ukončenie ukončí transkripciu vytvorením štruktúry vlásenkovej slučky a potom oblasti bohatej na U v transkripte.

Transkripcia je jedným z dvoch stupňov génovej expresie. Je to proces, ktorý produkuje sekvenciu mRNA z genetickej informácie ukrytej v sekvencii DNA génu. Prepis sa uskutočňuje tromi krokmi: začatím, predĺžením a ukončením. Enzým RNA polymerázy sa viaže na promótorovú sekvenciu génu a začína katalyzovať syntézu vlákna RNA. Kým sa nenájde terminátorová sekvencia, RNA polymeráza pridáva nukleotidy a vytvára RNA vlákno. V prokaryotoch dochádza k ukončeniu prostredníctvom dvoch hlavných stratégií ukončenia: Rho závislé ukončenie a Rho nezávislé ukončenie. Rho faktor je proteín, ktorý má helikázovú aktivitu.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je Rho závislé ukončenie
3. Čo je Rho nezávislé ukončenie
4. Podobnosti medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením
5. Porovnanie bok po boku - Rho závislé vs. Rho nezávislé ukončenie v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je Rho závislé ukončenie?

Rho závislé ukončenie je jedným z dvoch typov stratégie ukončenia transkripcie vyskytujúcich sa v prokaryotoch. Rho faktor je proteín, ktorý má helikázovú aktivitu.

Obrázok 01: Rho Závislé ukončenie

Rho proteín sa viaže s RNA transkriptom a pohybuje sa pozdĺž RNA polymerázy v smere 5'-3 ', čo podporuje disociáciu vodíkových väzieb medzi templátom DNA a transkriptom RNA. Keď faktor Rho dosiahne transkripčnú bublinu, ťahá hybrid DNA / RNA od seba a uvoľní prepis z transkripčnej bubliny. Ak k tomu dôjde, ukončí sa prepis.

Čo je Rho nezávislé ukončenie?

Rho nezávislé ukončenie je druhá stratégia, ktorá ukončí prokaryotickú transkripciu. Terminačná oblasť má obvykle invertovanú opakovaciu sekvenciu. Ihneď po obrátenej opakovacej sekvencii je oblasť bohatá na adenín (AAAA). Keď RNA polymeráza postupuje ďalej, vytvára sekvenciu mRNA. Pretože tieto dve oblasti sú komplementárne v invertovanej opakovanej sekvenčnej oblasti, tvoria vlásenkovú slučkovú štruktúru v dôsledku vodíkovej väzby. Ďalším regiónom bude región bohatý na U. Vlasová štruktúra zastavuje aktivitu RNA polymerázy.

Obrázok 02: Rho nezávislé ukončenie

Okrem toho v oblastiach bohatých na U existujú slabé interakcie medzi U bázami prepisu a A bázami templátu. Tieto slabé väzby adenín-urakcil destabilizujú DNA templát a RNA transkript a navzájom sa oddeľujú. Nakoniec sa transkript uvoľní z miesta transkripcie.

Aké sú podobnosti medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením?

• Rho dependentné a Rho nezávislé ukončenie sú dve hlavné terminačné stratégie nájdené v prokaryotoch.
• Obe formy uvoľňujú transkripciu z templátu DNA na ukončenie transkripcie.

Aký je rozdiel medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením?

Rho-dependentná terminácia je sprostredkovaná Rho proteínom, zatiaľ čo Rho-nezávislá terminácia nastáva tvorbou štruktúry vlásenkovej slučky. Toto je kľúčový rozdiel medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením. Ďalej, Rho proteín využíva energiu ATP, zatiaľ čo Rho nezávislé ukončenie nezahŕňa Rho proteín a nevyužíva energiu ATP. Preto je to tiež významný rozdiel medzi Rho závislým a Rho nezávislým zakončením.

Nižšie uvedený infographic ukazuje viac porovnaní týkajúcich sa rozdielu medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením.

Zhrnutie - Rho Dependent vs Rho Independent Termination

Rho dependentné a Rho nezávislé ukončenie sú dva hlavné mechanizmy terminácie transkripcie vyskytujúce sa v prokaryotoch. Proteín Rho je zodpovedný za termináciu transkripcie pri terminácii závislom od Rho. Naproti tomu k Rho nezávislému ukončeniu dochádza prostredníctvom formovania štruktúry vlásenkovej slučky. Toto je kľúčový rozdiel medzi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením.

referencie:

1. „Etapy transkripcie“. Khan Academy, k dispozícii tu.
2. „Vnútorné ukončenie.“ Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8. februára 2019, k dispozícii tu.

S láskavým dovolením:

1. „Rho-dependent terminator“ Autor: Oalnafo1 - Vlastné dielo (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Rho-nezávislý terminátor“ Autor: Ppgardne, anglický Wikipedia (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia