Rozdiel medzi zakoreneným a nekoreňovaným fylogenetickým stromom

Kľúčový rozdiel - zakorenený verzus nekorelovaný fylogenetický strom
 

Fylogenéza je dôležité pole, ktoré v priebehu času skúma život na Zemi. Odhaľuje spojenie medzi organizmami s ich predkami a potomkami. Vzťahy medzi organizmami sú schematicky znázornené rôznymi reprezentáciami podobnými stromu, ako sú dendogram, kladogram, fenogram, fylogram atď. Fylogenetický strom je vetviaci stromovitý diagram, ktorý vysvetľuje fylogenetické vzťahy medzi organizmami s veľkosťou evolučnej vzdialenosti. Existujú dva hlavné typy fylogenetických stromov známe ako korene a bez koreňa. Kľúčový rozdiel medzi zakoreneným a nekoreneným fylogenetickým stromom je ten zakorenený strom ukazuje najzákladnejšieho predka stromu zatiaľ čo Nekoreňovité fylogenetický strom nevykazuje koreň predkov.

OBSAH
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je zakorenený fylogenetický strom
3. Čo je nekoreňovaný fylogenetický strom
4. Porovnanie bok po boku - zakorenené verzus nekorelovaný fylogenetický strom
5. Zhrnutie

Čo je zakorenený fylogenetický strom?

Zakorenený fylogenetický strom slúži ako užitočný diagram, ktorý ukazuje vývojovú históriu. Má bazálny uzol, ktorý sa nazýva koreň a predstavuje spoločného predka všetkých skupín stromu. Koreň stromu sa považuje za najstarší bod v strome, ktorý predstavuje posledného spoločného predka všetkých skupín zahrnutých v strome. Zakorenený strom teda ukazuje smer evolučného času. Z jediného druhu zakoreneného stromu možno nájsť spoločného predka alebo predka druhu tak, že sa dáme vysledovať až k bazálnemu uzlu. Pretože zakorenený strom zobrazuje smer evolučného času, je ľahké nájsť staršie alebo novšie skupiny, ktoré má. Zakorenený strom možno použiť na štúdium celých skupín organizmov. Presné zakorenenie fylogenetického stromu je dôležitým a rozhodujúcim faktorom, pretože nepresné zakorenenie môže mať za následok nesprávnu interpretáciu genetických zmien medzi organizmami a ich smerovanie vývoja..

Obrázok 01: Zakorenený fylogenetický strom

Čo je nekoreňovaný fylogenetický strom?

Nekoreňovaný fylogenetický strom je fylogenetický diagram, ktorému chýba spoločný predok alebo bazálny uzol. Tento typ stromu neoznačuje pôvod vývoja záujmových skupín. Zobrazuje iba vzťah medzi organizmami bez ohľadu na smer evolučnej časovej línie. Preto je ťažké študovať vývojové vzťahy skupín s ohľadom na čas pomocou nekoreňovaného stromu.

Existujú dva hlavné spôsoby, ako zakoreniť nezakorenený fylogenetický strom. Oni sú

• Nájdenie vonkajšej skupiny - Vyžaduje si to predchádzajúce znalosti o vzťahoch medzi taxónmi. Potom môže byť taxón, ktorý leží mimo skupiny, použitý ako skupina na zakorenenie zakoreneného fylogenetického stromu

• Nájdenie stredu alebo vzdialenosti - stred dvoch najvzdialenejších dvoch taxónov v strome možno považovať za koreň fylogenetického stromu.

Obrázok 02: Nekoreňovaný fylogenetický strom

Aký je rozdiel medzi zakoreneným a nekoreňovaným fylogenetickým stromom?

Zakorenený verzus nekorelovaný fylogenetický strom
Zakorenený fylogenetický strom je schéma, ktorá zobrazuje posledného spoločného predka skupín.	Nekoreňovaný fylogenetický strom ukazuje vzťahy medzi organizmami bez toho, aby ukazoval spoločného predka.
uzol
Má uzol (root).	Nemá uzol.
Smer vývoja
Má smer naznačovať vývojový čas.	Nešpecifikuje evolučný vzťah.
Postoj k ostatným
Strom umožňuje určiť vzťah medzi predkami a potomkami medzi skupinami.	Strom neumožňuje hovoriť o vzťahu medzi predkom a potomkom.

Zhrnutie - zakorenené vs nekorelovaný fylogenetický strom

Fylogenetický strom predstavuje vývojové cesty a spojenia medzi organizmami pomocou rozvetvených stromových diagramov. Fylogenetický kmeň môže mať korene alebo korene. Zakorenený strom má na základni uzol, ktorý predstavuje spoločného predka, ktorý spája všetky záujmové skupiny. Nekoreňovaný strom ukazuje vzťahy medzi organizmami. Nezobrazuje však spoločného predka, ktorý zdieľajú všetky skupiny. Toto je rozdiel medzi zakoreneným a nekoreňovaným fylogenetickým stromom.

Referencie:
1. „Fakty“ o stromoch: zakorenené verzus nekoreňované stromy. “ Národné centrum pre biotechnologické informácie. U.S. National Library of Medicine, n.d. Web. 04. apríl 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead a Spencer C. H. Barrett. "Zakorenenie fylogenetických stromov so vzdialenými skupinami: Prípadová štúdia od komelinoidných monokokov." Molekulárna biológia a evolúcia. Oxford University Press, 01.10.2002. Web. 04. apríl 2017