siRNA vs miRNA
RNA sú veľmi dôležité molekuly, ktoré pomáhajú budovať život organizmov. Vedci nedávno objavili malé RNA nazývané RNA interferencia alebo RNAi, ktoré pôsobia po transkripcii na kontrolu génovej expresie. Dva hlavné typy malých RNA sú mikro RNA alebo miRNA a malá interferujúca RNA alebo siRNA. Tieto molekuly v podstate regulujú génovú expresiu potlačením cieľového génu. MiRNA aj siRNA majú veľmi podobné dráhy biogenézy, aj keď medzi nimi existujú určité rozdiely. Pôvod miRNA a siRNA je z molekúl dsRNA. Zrelé miRNA sú štruktúrne podobné siRNA molekulám.
miRNA
Mikro RNA alebo miRNA sú malé molekuly RNA, ktoré sprostredkujú konečnú kontrolu regulácie translačného génu. Deregulácia miRNA môže viesť k rozvoju rakoviny a iných chorôb. Správna regulácia informácií kódovaných v nekódujúcej oblasti miRNA je preto v mnohých základných bunkových procesoch veľmi kritická.
siRNA
siRNA sa tiež označujú ako krátka interferujúca alebo tlmiaca RNA a sú vyrobené z dvojreťazcovej RNA s 20 až 25 pármi báz. Hlavnou úlohou siRNA je interferovať s expresiou špecifických génov s komplementárnymi nukleotidovými sekvenciami. siRNA je tvorená krátkou dvojreťazcovou RNA s fosforylovanými 5 'koncami a hydroxylovanými 3' koncami s dvoma previsnutými nukleotidmi.
Aký je rozdiel medzi siRNA a miRNA?
• miRNA odvodená od špecifických genomických lokusov, zatiaľ čo siRNA odvodená od mRNA, transpozónov, vírusov alebo heterochromatickej DNA.
• Syntéza miRNA je spracovaná z dlhších prekurzorových vlásenkových transkriptov (primárna nukleárna sekvencia miRNA endonukleázou RNázy III), zatiaľ čo syntéza siRNA spracovaná z dlhých bimolekulárnych duplexov RNA.
• Každá miRNA vlásenková prekurzorová molekula produkuje jeden miRNA duplex, zatiaľ čo každá siRNA prekurzorová molekula produkuje viac siRNA duplexov.
• siRNA sekvencie sú zriedka konzervované, zatiaľ čo miRNA sekvencie sú dobre konzervované.
• Všetky bázy v siRNA prispievajú k svojej cieľovej špecifickosti, zatiaľ čo iba 5 'polovica miRNA prispieva k svojej cieľovej špecifickosti.
• miRNA sa často viaže na 3 'netranslatovanú oblasť cieľových transkriptov, zatiaľ čo siRNA tvoria komplementárny duplex kdekoľvek pozdĺž cieľovej mRNA..
• miRNA špecifikuje „heterosumovanie“, zatiaľ čo siRNA použitá pre „automatické umlčanie“.
• miRNA pôsobí ako signál na zabránenie translácie, zatiaľ čo siRNA fyzicky bráni translácii.