Rozdiel medzi Ti a Ri plazmidom
Share
Kľúčový rozdiel - Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium je bakteriálny rod, ktorý spôsobuje niekoľko chorôb v dvojklíčnolistových rastlinách vrátane ochorenia koruny a žltačky a ochorenia chlpov koreňov. Tieto dve choroby sú kódované génmi umiestnenými v plazmidoch (nechromozomálna DNA) baktérií. Bakteriálne druhy Agrobacterium tumerfaciens nesie a plazmid indukujúci nádor (Ti plazmid), ktorý je zodpovedný za ochorenie žlčníkov v rastlinách. Agrobacterium rhizogenes je ďalšia baktéria, ktorá obsahuje plazmid indukujúci korene (Ri plazmid) zodpovedný za ochorenie chlpov koreňov rastlín. Plazmidy Ti a Ri sú patogénne plazmidy jedinečné pre tento bakteriálny rod. Kľúčový rozdiel medzi Ti a Ri plazmidom je ten Ti plazmid je kódovaný génmi zodpovednými za spôsobenie ochorenia žlčníkov, zatiaľ čo plazmid Ri je kódovaný génmi pre ochorenie vlasatých koreňov v rastlinách. Tieto patogénne plazmidy obsahujú génové klastre zodpovedné za replikáciu DNA, virulenciu, T-DNA, využitie opínu a konjugáciu. Počas infekcie, Agrobacterium exciduje svoju T-DNA (transfer DNA) oblasť plazmidu a integruje sa s rastlinným genómom, aby spôsobil ochorenie. Túto schopnosť využívajú molekulárni biológovia na zavádzanie dôležitých génov do rastlín v genetickom inžinierstve. z toho dôvodu, Agrobacterium sa považuje za dôležitý nástroj v biotechnológii a molekulárnej biológii na zavedenie chimérickej DNA do rôznych druhov rastlín.
OBSAH
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je Ti Plasmid
3. Čo je Ri Plasmid
4. Porovnanie vedľa seba - Ti vs Ri Plasmid
5. Zhrnutie
Čo je Ti Plasmid?
Plazmid indukujúci nádor (Ti plazmid) je väčší plazmid, ktorý obsahuje Agrobacterium tumerfaciens spôsobiť ochorenie žlčníka u širokého spektra rastlín dvojklíčnolistých rastlín. Názov choroba korunových žlčníkov sa používa v dôsledku vytvárania veľkých opuchov podobných typu nádorov (galls) v korunách rastlín nad povrchom pôdy v dôsledku nadmernej produkcie rastlinných hormónov auxínu a cytokinínov pôsobením A. tumerfaciens. Oblasť T-DNA obsahuje gény indukujúce nádor. Agrobacterium tumerfaciens vstupuje do rastlín cez poškodené rastlinné tkanivá, najmä rany, a prenáša svoju časť plazmidovej DNA (T-DNA) spolu s génmi spôsobujúcimi ochorenie do rastlinných buniek. Táto T-DNA sa potom integruje do genómu rastlinných buniek a transkribuje. Expresia génov spôsobuje vznik nádorov a súvisiace zmeny metabolizmu buniek. Choroba žlčníka nespôsobuje vážne škody starším rastlinám. Znižuje to však kvalitu škôliek.
Vďaka tomuto jedinečnému spôsobu infekcie, A. tumerfaciens sa vo veľkej miere používa ako nástroj v genetickom inžinierstve na produkciu transgénnych rastlín. Gény indukujúce nádor sú potlačené a požadované gény, ako sú gény rezistentné na insekticídy a herbicídy, sú vložené alebo rekombinované do Ti plazmidu s použitím technológie rekombinantnej DNA a použité v programoch šľachtenia rastlín. Keď sa T-DNA prenáša po infekcii A. tumerfaciens na rastliny rastliny získavajú prirodzene účinky požadovaných génov. Preto môže byť akákoľvek cudzia DNA vložená do T-DNA integrovaná do genómov rastlinných buniek pomocou procesu prirodzenej infekcie tejto baktérie..
Obrázok 01: Ti plazmid z A. tumerfaciens
Čo je Ri Plasmid?
Plazmid indukujúci korene (Ri Plasmid) je plazmid, ktorý nesie baktéria A. rhizogenes. Plazmid Ri je zodpovedný za ochorenie nazývané ochorenie vlasatých koreňov v dvojklíčnych rastlinách. Infekcia A. rhizogenes spôsobuje rozsiahlu tvorbu náhodných koreňov v mieste infekcie alebo blízko neho. Gény vyvolávajúce chlpaté korene sa nachádzajú v oblasti T-DNA plazmidu Ri. Plazmid Ri je väčší plazmid podobný plazmidu Ti. A. rhizogenes je tiež schopný prenášať oblasť T-DNA RI plazmidu do rastlinných buniek a integrovať sa s genómom rastlinných buniek, aby sa transkribovalo pomocou strojového zariadenia rastlinných buniek na vyvolanie chorôb. Preto plazmidy Ri tiež slúžia ako dôležité vektory v genetickom inžinierstve rastlín.
Aký je rozdiel medzi Ti a Ri Plasmidom?
Ti vs Ri Plasmid | |
| Ti plazmid je kruhový a väčší plazmid, ktorý obsahuje . tumerfaciens | Ri plazmid je kruhový a väčší plazmid, ktorý obsahuje .rhizogenes |
| choroba | |
| Plazmid Ti kóduje gény na ochorenie žlčníkov v rastlinách | Ri plazmid kóduje gény pre chlpy chlpov koreňov v dvojklíčnych rastlinách. |
Zhrnutie - Ti vs Ri Plasmids
Plazmidy Ti a Ri sú patogénne plazmidy nesúce A. tumerfaciencs a A. rhizogenes, resp. Ti plazmid má gény indukujúce nádor, ktoré spôsobujú ochorenie žlčníkov v rastlinách. Ri plazmid má gény vyvolávajúce korene, ktoré spôsobujú chlpaté korene rastlín. Toto je hlavný rozdiel medzi Ti a Ri plazmidmi. Tieto plazmidy sa môžu použiť ako vektory v rastlinnom genetickom inžinierstve vďaka svojej prirodzenej schopnosti prenášať časť svojej plazmidovej DNA do hostiteľského genómu. Obsahujú génové zhluky a ich veľkosť je približne 200 kbp. Každý plazmid obsahuje jedinečné gény.
Referencie
1. Katsunori Suzuki, Katsuyuki Tanaka, Shinji Yamamoto, Kazuya Kiyokawa, Kazuki Moriguchi a Kazuo Yoshida. 2. „Plazmidy Ti a Ri.“ Springer. Springer Berlin Heidelberg, 1. januára 1970. Web. 21. apríla 2017
3. Zupan, J.R. a P. Zambryski. "Prenos T-DNA z Agrobacterium do rastlinnej bunky." Fyziológia rastlín. U.S. National Library of Medicine, apríl 1995. Web. 22. apríla 2017
S láskavým dovolením:
1. „Ti plazmid“ od MouagipTento vektorový grafický obrázok bol vytvorený pomocou programu Adobe Illustrator. - Vlastná práca (CC0) prostredníctvom Commons Wikimedia
