Zatiaľ čo teoretická termodynamika interakcií antigén-protilátka je dobre známa, ich praktické použitie pri detekcii alebo stanovení autoprotilátok je zriedkavé. Pre funkčné protilátky umožňuje stanovenie optimálnej afinity dosiahnutie maximálneho terapeutického prínosu. Afinita protilátok sa študovala takmer pol storočia a od vzniku afinitnej chromatografie pred tromi desaťročiami sa vyvinula v mocný nástroj. Afinita opisuje interakciu v individuálnom väzbovom mieste. Znalosť afinity, ako aj konštrukčných a antigénnych vlastností je nevyhnutná na vyhodnotenie spojenia medzi afinitou a účinnosťou funkčnej protilátky. Avšak okrem afinity existuje ešte jeden väzbový koncept nazývaný avidita, čo je celková väzbová sila interakcie medzi multivalentným antigénom a multivalentnou protilátkou. Napriek jasným rozdielom medzi týmito dvoma pojmami sa často často používajú pojmy afinita a avidita. Pozrime sa na dva.
Afinita je sila väzby paratopu jednej molekuly protilátky s jej zodpovedajúcim epitopom na molekule antigénu. Opisuje interakciu v individuálnom väzbovom mieste. Znalosť afinity, ako aj konštrukčných a antigénnych vlastností je nevyhnutná na vyhodnotenie spojenia medzi afinitou a účinnosťou funkčnej protilátky. Je založený na rovnakých termodynamických princípoch, ktoré riadia akúkoľvek reverzibilnú biomolekulárnu interakciu, rovnakú väzbovú silu, ktorá umožňuje imunitným systémom bojovať proti infekciám. A sila sa týka sily špecifickej väzby medzi protilátkou a jej antigénom. Presné a presné vyhodnotenie afinity pre interakciu antigén-protilátka je dôležité meranie na stanovenie limitov afinity a maximálneho účinku pre terapeutickú protilátku. Z termodynamického hľadiska sa afinita vyjadruje ako súčet všetkých atraktívnych síl, ktoré vedú k zvýšenej väzbovej sile a odpudivým silám, ktoré vedú k zníženej väzbovej sile.
Avidita je ďalším záväzným pojmom, ktorý je často zamieňaný s afinitou; v skutočnosti sa oba termíny vzťahujú na koncepciu väzbovej sily, s výnimkou avidity sa vzťahuje na celkovú silu antigén viažucej kapacity zmesi polyklonálnych protilátok. Avidita prichádza do obrazu, keď sa multivalentný antigén viaže na bivalentnú protilátku v roztoku alebo keď sa protilátka viaže na dve monovalentné antigénové molekuly na povrchu. Na rozdiel od afinity avidita opisuje multivalentnú väzbu medzi viacerými väzbovými miestami ligandu a ligátu. Jednoducho povedané, avidita je väzobná sila medzi multivalentnou protilátkou a multivalentným antigénom. Aviditu nemožno opísať termodynamickými výrazmi a je získaná kinetickými meraniami. Avidita protilátky závisí od afinity jednotlivých väzobných miest pre protilátku, ale je vyššia ako väzobná afinita, pretože všetky interakcie protilátka-antigén sa musia prerušiť súčasne, aby sa protilátka úplne disociovala.
Pojmy afinita a avidita sa niekedy nevhodne používajú ako synonymá. V skutočnosti sa oba pojmy vzťahujú na pojem záväznej sily. Afinita je definovaná termodynamicky ako meranie stupňa asociácie medzi protilátkou a antigénom, zatiaľ čo celková sila viažuca viacmocnú protilátku na viacmocný antigén sa označuje ako avidita alebo inak známa ako „funkčná afinita“. Afinita je sila väzby protilátkového kombinačného miesta na jeden zodpovedajúci antigénový epitop, zatiaľ čo avidita je celková sila antigén-väzobnej kapacity zmesi polyklonálnych protilátok. Avidita sa označuje aj ako funkčná afinita.
Termín afinita označuje vnútornú asociačnú konštantu medzi protilátkou a jednoväzbovým ligandom, ako je haptén, zatiaľ čo výraz avidita sa používa na označenie celkovej väzbovej energie medzi protilátkami a multivalentným antigénom. Asociačná konštanta je miera afinity protilátky k epitopu. Aviditu nemožno opísať termodynamickými výrazmi a je získaná kinetickými meraniami. Z termodynamického hľadiska sa afinita vyjadruje ako súčet energie blízkych intermolekulárnych príťažlivých a odpudivých síl medzi antigénnym determinantom a jeho väzobným miestom..
Afinita protilátok môže hrať rozhodujúcu úlohu pri určovaní biologických aktivít protilátok. Preto je potrebné dokázať charakterizovať protilátkovú reakciu z hľadiska afinity, ako aj veľkosti, a tiež pochopiť, ako afinita protilátky môže ovplyvniť konkrétny test. Termín avidita sa niekedy používa synonymne s afinitou, ale najčastejšie sa používa na opis schopnosti protilátok tvoriť stabilné komplexy s antigénom. Avidita je nahromadená sila viacerých afinít jednotlivých väzobných miest pre protilátky.
Napriek ich rozdielom sa pojmy afinita a avidita často používajú bez rozdielu. Afinita je sila väzby paratopu jednej molekuly protilátky s jej zodpovedajúcim epitopom na molekule antigénu a môže byť stanovená iba jedným monovalentným fragmentom Fab. Je to súčet všetkých atraktívnych síl, čo vedie k zvýšenej väzbovej sile a odpudivým silám, ktoré vedú k zníženej väzbovej sile. Avidita, na druhej strane, je väzobná sila medzi multivalentnou protilátkou a multivalentným antigénom a je tiež označovaná ako funkčná afinita. Nameraná väzbová energia medzi protilátkami a ich zodpovedajúcimi antigénmi odráža aviditu protilátok. Na rozdiel od afinity nemožno aviditu opísať termodynamickými výrazmi a je získaná kinetickými meraniami.