Rozdiel medzi agarózou a polyakrylamidom

Agaróza verzus polyakrylamid
 

Agaróza a polyakrylamid sú oba vo vode rozpustné polyméry, ale medzi nimi je možné vidieť mnoho rozdielov, počnúc ich pôvodom. Agaróza aj polyakrylamid majú niečo spoločné v schopnosti vytvárať pórovité gélové matrice. Napriek tomu existuje medzi nimi dva výrazné rozdiely. Hlavné rozdiely medzi obidvoma týmito polymérmi spočívajú v ich povahe pôvodu, chemickej štruktúre, ich rôznych použitiach a ich účinnosti z hľadiska gélovej elektroforézy..

Čo je Agarose?

Agaróza je prírodne sa vyskytujúci lineárny polymér, ktorý je zase odvodený od komplexného polyméru nazývaného agar nachádzajúci sa v morských riasach. Agaróza sa extrahuje z agaru odstránením jej bielkovinovej zložky nazývanej agaropektinu. Agaróza dáva agaru schopnosť vytvárať gély.

Hlavné použitie agarózy je v mikrobiologických a molekulárno-biologických štúdiách. V mikrobiologických štúdiách poskytuje agaróza po doplnení vhodnými živinami pevný základ pre kultiváciu mikroorganizmov, ako sú baktérie a huby. Ak sa používa v polotuhých koncentráciách, môže byť užitočný pri hodnotení pohyblivosti týchto mikroorganizmov. V molekulárnej biológii slúži ako dôležitý nástroj pre jeden z najzákladnejších procesov rozlíšenia nazývaný „gélová elektroforéza„alebo“elektroforéza na agarózovom géli' (VEK). Gélová elektroforéza je proces, ktorý umožňuje rozlíšenie alebo separáciu nukleových kyselín alebo proteínov na základe ich veľkosti a náboja. Agaróza tu slúži ako porézny gél podobný sita, cez ktorý dochádza k separácii.

Štruktúra agaru

Čo je polyakrylamid?

Polyakrylamid je syntetický polymér a používa sa v mnohých priemyselných odvetviach. Ako už bolo uvedené, jeho použitie sa spolieha na svoju schopnosť tvoriť gély. Okrem toho sa však v rôznych priemyselných odvetviach využíva aj jej schopnosť zadržiavať a odvádzať vodu v rôznych koncentráciách.

Najrozšírenejšie a najrozšírenejšie polyakrylamid sa bežne používa na čistenie odpadových vôd. Tu sa používa ako flokulačné činidlo na odstránenie akéhokoľvek suspendovaného organického materiálu; teda zlepšenie zákalu a vyčírenie vody. Ďalšie použitie polyakrylamidu je v papierenskom priemysle. Tu sa používa buď na zadržanie alebo vypustenie vody z papierovej buničiny podľa potreby. Podobne v poľnohospodárskom a stavebnom priemysle sa používa ako kondicionér pôdy na zabránenie erózii pôdy a zlepšenie jej kvality.

Rovnako ako agaróza, aj polyakrylamid sa používa v molekulárnej biológii ako dôležitý nástroj na rozlíšenie v podobnom procese nazývanom „Elektroforéza na polyakrylamidovom géli “(PAGE). Okrem toho sa polyakrylamid používa aj pri spracovaní rudy a pri výrobe flokulačného činidla na odstránenie akéhokoľvek suspendovaného organického materiálu; teda zlepšenie zákalu a vyčírenie vody. Ďalšie použitie polyakrylamidu je v papierenskom priemysle. Tu sa používa buď na zadržanie alebo vypustenie vody z papierovej buničiny podľa potreby. Podobne v poľnohospodárskom a stavebnom priemysle sa používa ako kondicionér pôdy na zabránenie erózii pôdy a zlepšenie jej kvality. Okrem toho sa polyakrylamid používa aj na výrobu potravinárskych prísad, mäkkých kontaktných šošoviek a textilu..

Štruktúra polyakrylamidu

Aký je rozdiel medzi agarózou a polyakrylamidom?

Pôvod agarózy a polyakrylamidu:

Agarose: Agaróza je polymér prírodného pôvodu. Je odvodený z morských rias.

polyakrylamid: Polyakrylamid je syntetického pôvodu a nenachádza sa za žiadnych prírodných okolností.

Molekulárny vzorec agarózy a polyakrylamidu:

Agarose: Molekulový vzorec agarózy je C₂₄H₃₈O₁₉.

polyakrylamid: Molekulový vzorec polyakrylamidu je (C ₃H₅NO)_n.

Chemická štruktúra agarózy a polyakrylamidu:

Agarose: Agaróza je lineárny polysacharid. Skladá sa z opakujúcich sa disacharidových jednotiek nazývaných agrobióza, ktoré sú držané pohromade vodíkovými väzbami.

polyakrylamid: Polyakrylamid je chemicky zosieťovaný polymér. Skladá sa z akrylamidových monomérov a sieťovadla N, N'-metylénbisakrylamidu..

Toxicita agarózy a polyakrylamidu:

Agarose: Agaróza a jej monomérna jednotka agrobiózy sú vo svojej podstate netoxické.

polyakrylamid: Monomérna jednotka polyakrylamidu, akrylamidu, je predpokladaným karcinogénom a známym neurotoxínom, zatiaľ čo jeho polymerizovaná forma je v prírode netoxická.

Vlastnosti agarózových a polyakrylamidových gélov:

AGE a PAGE:

Agarose: Agarózový gél pre AGE je menej časovo náročný, ľahký a jednoduchý a nevyžaduje iniciátor alebo polymerizačný katalyzátor..

polyakrylamid: Polyakrylamidový gélový prípravok pre PAGE je časovo náročný a zdĺhavý a vyžaduje si tiež iniciátor (persíran amónny) a polymerizačný katalyzátor (N, N, N ', N'-tetrametyletylendiamín - TEMED)..

Nature:

Polyakrylamidové gély sú chemicky stabilnejšie ako agarózové gély.

Veľkosť pórov:

Pri rovnakej koncentrácii majú matrice polyakrylamidového gélu tendenciu mať menšie veľkosti pórov v porovnaní s matricou na agarózovom géli..

Zmena veľkosti pórov:

Veľkosť pórov polyakrylamidových gélov sa môže meniť kontrolovanejším spôsobom ako pri agarózových géloch..

Výkon riešenia:

Polyakrylamidové gély majú vysokú rozlišovaciu schopnosť, zatiaľ čo agarózové gély majú nízku rozlišovaciu schopnosť.

Ubytovanie v nukleovej kyseline:

Polyakrylamidové gély môžu pre účely štiepenia pojať väčšie množstvá nukleových kyselín ako agarózové gély.

Snímky so zvolením: Agaróza a štruktúra polyakrylamidu prostredníctvom Wikicommons (Public Domain)