Rozdiel medzi agarózou a polyakrylamidom

Agaróza verzus polyakrylamid

Existujú rôzne rozdiely týkajúce sa agarózy a polyakrylamidu vrátane ich fyzikálnej štruktúry, toxicity a metód ich odliatia, ako aj ich ceny. Je užitočné poznať tieto rozdiely, ako aj ich podobnosti, ak máte čo do činenia s niektorým z týchto typov gélov.

Jedným z hlavných rozdielov medzi týmito dvoma gélmi je to, že agaróza sa nalieva horizontálne, zatiaľ čo polyakrylamid sa nalieva vertikálne. Je oveľa ľahšie naliať agarózu týmto horizontálnym spôsobom. Agaróza môže byť zahrievaná, aby napomáhala procesu liatia, hoci by nemala byť zahrievaná do takého stupňa, že agaróza končí topením. Dá sa tiež rozhodnúť, či použiť úzky alebo široký pruh na naliatie agarózy. Môže sa liať pomocou tohto spôsobu zapichovania, a to je jedna z jeho výhod. Počas nalievania je potrebné postupovať mimoriadne opatrne, pretože agaróza je veľmi jemná a ľahko sa zlomí.

Na druhej strane, ako už bolo uvedené, polyakrylamid sa naleje vertikálne. Pri tomto procese potrebuje polyakrylamid sklenené dosky, pretože jeho štruktúra je veľmi tenká a táto dodatočná podpora je potrebná. Na rozdiel od agarózy sa polyakrylamid nedá znovu zahriať a potom naliať.

Agaróza pozostáva z mnohých molekúl, zatiaľ čo polyakrylamid sa spravidla skladá iba z jednej veľkej molekuly. Molekuly agarózy sú držané pohromade medzimolekulovými silami a molekuly sú tvorené DNA. Existujú veľké a malé molekuly a vo všeobecnosti sú väčšie molekuly ľahšie oddeliteľné ako menšie. Molekula polyakrylamidu je vytvorená z DNA alebo proteínu. Medzery medzi gélmi polyakrylamidu sú menšie ako medzery medzi gélmi agarózy, čo je ďalší rozdiel medzi týmito dvoma látkami. Ak je veľkosť prúžkov rovnaká v agaróze, existujú rôzne veľkosti prúžkov v polyakrylamide. Ak je polyakrylamidová molekula vystavená vzduchu, neztuhne rovnomerne, pretože vzduch polymerizuje proces polymerizácie..

Pokiaľ ide o toxicitu, agaróza sa považuje za netoxickú látku. Aj keď sa polyakrylamid považuje za rovnaký, jeho prášok sa považuje za toxický a je rozumné manipulovať s gélom ochrannými opatreniami..

Polyakrylamid sa používa na sekvenovanie gélov a proteínových gélov. Jeho výhodou je, že má ľahké farbiace vlastnosti a môže sa sušiť za vzniku gélu. Je zakúpená vopred naliata a je lacnejšia ako agaróza, približne 5 $ 7 'na gél. (Agaróza je asi 1 dolár na gram). Pred zakúpením jedného z týchto dvoch gélov sa odporúča, aby osoba mala dostatočné skúsenosti. Pred akýmkoľvek nákupom musí byť známy počet potrebných vzoriek a koncentrácia gélu, ktorá je potrebná..

Zhrnutie:

1.Agaróza sa naleje horizontálne, zatiaľ čo polyakrylamid sa naleje vertikálne.
2.Agaróza je drahšia ako polyakrylamid.
3.Aaróza pozostáva z mnohých molekúl, zatiaľ čo polyakrylamid pozostáva iba z jednej veľkej molekuly.
4. Na rozdiel od polyakrylamidu sa agaróza môže znova zahriať.
5.Agaróza sa považuje za netoxickú látku vo všetkých svojich formách, zatiaľ čo prášok polyakrylamidu sa považuje za toxický.