Rozdiel medzi maximálnym príjmom a maximálnou pravdepodobnosťou

kľúčový rozdiel medzi maximálnou parsimóniou a maximálnou pravdepodobnosťou závisí od metódy použitej pri vývoji fylogenetického stromu. Maximálna parsimónia sa zameriava na minimalizáciu celkových stavov postavy počas konštrukcie fylogenetického stromu, zatiaľ čo maximálna pravdepodobnosť je štatistický prístup pri kreslení fylogenetického stromu v závislosti od pravdepodobnosti medzi genetickými údajmi..

Phylogeny je nový prístup k klasifikácii a nomenklatúre organizmov. Phylogeny sa spolieha na genetické údaje a vývojové vzťahy. Genetické údaje sú výsledkom sekvenovania DNA. Vo fylogéne sa klasifikácia organizmov uskutočňuje na základe spoločného predka. Maximálna parsimónia a maximálna pravdepodobnosť fylogenetického vzťahu zvyšujú presnosť a spoľahlivosť fylogenetického stromu..

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to maximálne parsimony 
3. Aká je maximálna pravdepodobnosť
4. Podobnosti medzi maximálnym príjmom a maximálnou pravdepodobnosťou
5. Porovnanie bok po boku - maximálna pravdepodobnosť v porovnaní s maximálnou pravdepodobnosťou v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je to maximálne parsimony?

Pri technike maximálnej parsimónie sa pri fylogenetickej analýze minimalizuje celková zmena stavu. Fylogenetika je odvetvie biológie, ktoré sa zaoberá štúdiom evolučných vzťahov. Fylogenetický strom je strom, ktorý ukazuje vývojové vzťahy založené na spoločnom predchodcovi. Pri kreslení fylogenetického stromu pomocou konceptu maximálnej parsimónie sa teda minimalizuje množstvo paralelného vývoja. Preto maximálna parsimónia vygeneruje strom oveľa rýchlejšie ako iné metódy. Je to preto, že pri maximálnej parsimónii sa berú do úvahy iba hlavné rozlišovacie charakteristiky.

Obrázok 01: Maximálne parsimony

Pri kreslení maximálneho stromu podobného stromu je strom vždy najkratší možný strom s minimálnym počtom taxónov. Spoľahlivosť maximálneho parsimonious stromu je však veľmi vysoká. Štatistická konzistentnosť a presnosť fylogenetického vzťahu založeného na maximálnej parsimónii sa bude líšiť. Okrem toho existujú komplexné algoritmy, ktoré analyzujú maximálnu parsímiu fylogenetického vzťahu.

Aká je maximálna pravdepodobnosť?

Maximálna pravdepodobnosť je jednou z najpoužívanejších štatistických metód, ktoré analyzujú fylogenetické vzťahy. Táto metóda bude analyzovať fylogenézu na základe pravdepodobnostného modelu. Ďalej táto metóda berie do úvahy priemer a rozptyl. Vo fylogenénii sa teda maximálna pravdepodobnosť získa z daných genetických údajov konkrétneho organizmu.

Obrázok 02: Maximálna pravdepodobnosť

Pri použití štatistickej metódy maximálnej pravdepodobnosti existujú výhody aj nevýhody. Táto metóda je veľmi vhodná pri analýze jednoduchého súboru údajov obsahujúceho genetické informácie. Ak je stupeň rozptylu medzi genetickými údajmi nižší, sú maximálne skóre pravdepodobnosti spoľahlivé. Výsledky dosiahnuté s maximálnou pravdepodobnosťou ďalej potvrdzujú maximálne skóre parsimónie konkrétneho fylogenetického vzťahu. Analýza maximálnej pravdepodobnosti preto slúži ako potvrdzujúci test.

V porovnaní s vyššie uvedenými výhodami je táto metóda pomalý a intenzívny proces. Okrem toho v prípade neexistencie jediného súboru údajov je chybový výstup vysoký. To tiež sťažuje reprodukovateľnosť výsledkov odhadom maximálnej pravdepodobnosti.

Aké sú podobnosti medzi maximálnym príjmom a maximálnou pravdepodobnosťou?

• Maximálna parsimónia a maximálna pravdepodobnosť sú dva prístupy, ktoré zohrávajú vo fylogéne dôležitú úlohu.
• Obe techniky znázorňujú vzťah organizmu k jeho predkom na základe dostupných genetických údajov.
• Fylogenetické stromy sa môžu interpretovať pomocou maximálnej parsimónie a maximálnej pravdepodobnosti.
• Pri oboch technikách sa genetické údaje spoliehajú na sekvenovanie DNA alebo sekvenovanie RNA.
• Obidve metódy sú dôležité pri vytváraní fylogenetických stromov.

Aký je rozdiel medzi maximálnym príjmom a maximálnou pravdepodobnosťou?

Maximálna parsimónia aj maximálna pravdepodobnosť sú dva rôzne prístupy pri interpretácii fylogenetického stromu. Maximum parsimony verí v analýzu niekoľkých charakteristík a minimalizáciu zmien charakteru z organizmu na organizmus. Na rozdiel od toho metóda maximálnej pravdepodobnosti berie do úvahy priemer a rozptyl a získa maximálnu pravdepodobnosť daných genetických údajov konkrétneho organizmu. Toto je kľúčový rozdiel medzi maximálnou parsimóniou a maximálnou pravdepodobnosťou.

Okrem toho spoľahlivosť samotného maximálneho parsimónu nie je dostatočná na vyvodenie záveru. Metóda maximálnej pravdepodobnosti však slúži ako potvrdzujúci test výsledkov maximálnej parsimónie. Preto by sa závery mali robiť s použitím maximálnej parsimónie a maximálnej pravdepodobnosti.

Nižšie uvedená infografia sumarizuje rozdiel medzi maximálnou pravdepodobnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou.

Zhrnutie - maximálna pravdepodobnosť v porovnaní s maximálnou pravdepodobnosťou

Fylogénia hrá dôležitú úlohu pri odvodzovaní evolučných vzťahov vytváraním fylogenetických stromov. Maximum parsimony je technika vytvárania stromu s minimálnym počtom zmien stavu. Naopak, maximálna pravdepodobnosť fylogenetického stromu spočíva v použití maximálnej podobnosti medzi genetickými údajmi. Dáta pre obe analýzy pochádzajú z DNA alebo RNA sekvenčných údajov. Spoľahlivosť a presnosť sú vysoké, keď sa uskutočňuje stavba stromu pomocou oboch techník. Týmto sa sumarizuje rozdiel medzi maximálnou parsimóniou a maximálnou pravdepodobnosťou.

referencie:

1. Elliott. "Súťaž medzi parsimóniou a pravdepodobnosťou." OUP Academic, Oxford University Press, 1. augusta 2004, k dispozícii tu.

S láskavým dovolením:

1. „Maximálny strom stromov haploskupiny B2b“ autormi Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L, a kol. (2013) Genetické dedičstvo predkoloniálneho obdobia v súčasných bolívanoch. PLoS ONE 8 (3): e58980. doi: 10.1371 / journal.pone.0058980 (CC BY 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Strom maximálnej pravdepodobnosti Lactarius blennius a príbuzných“ Autor: Thkgk - Vlastné dielo (CC0) prostredníctvom Commons Wikimedia