Rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom

Kľúčový rozdiel - minisatelit verzus mikrosatelit
 

Opakujúca sa DNA sú nukleotidové sekvencie, ktoré sa opakovane opakujú v genóme organizmov. Repetitívna DNA predstavuje významnú časť genómovej DNA a existujú tri hlavné typy nazvané tandemové repetície, terminálne repetície a interspersované repetície. Tandemové opakovania sú vysoko opakované sekvencie, ktoré ležia vedľa seba bez prerušenia. V genóme stavovcov existujú tri hlavné typy tandemových repetícií. Sú to satelitné DNA, mikrosatelitné DNA a minisatelitné DNA. Minisatellit je časť vysoko opakovanej DNA, ktorá pozostáva zo série opakujúcich sa sekvencií zložených z 10 až 100 párov báz. Mikrosatelit je časťou repetitívnej DNA, ktorá pozostáva z krátkych opakujúcich sa sekvencií zložených z 1 až 9 párov báz. Kľúčový rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom je preto veľkosť alebo dĺžka opakujúcej sa sekvencie.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je minisatelit
3. Čo je to mikrosatelit
4. Podobnosti medzi minisatelitom a mikrosatelitom
5. Porovnanie bok po boku - minisatelit verzus mikrosatelit v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je minisatelit?

Minisatelitná DNA je časť DNA, ktorá obsahuje sériu krátkych opakujúcich sa sekvencií DNA, ktoré majú dĺžku 10 až 60 bázových párov. Minisatelity sa označujú aj ako variabilný počet opakovaní tandemu (VNTR). Minisatelity sú často zamieňané s mikrosatelitmi. Vedci však teraz rozlišujú minisatelity a mikrosatelity na základe veľkosti opakujúcej sa sekvencie.

Minisatelity sa v ľudskom genóme nachádzajú na viac ako 1000 miestach. Tieto krátke sekvencie sú bohaté na G a C. Počet opakovaní v danom minisatelite sa medzi jednotlivcami značne líši.

Prvý ľudský minisatelit identifikovali A. R. Wyman a R. White v roku 1980. Neskôr objavil Alec Jeffreys extrémny polymorfizmus počtu kópií minizatelitov medzi organizmami. Tieto objavy robili z minisatelitov ideálne markery pre DNA fingerprinting, analýzu väzieb a populačné štúdie. Minisatelity tiež prispievajú k regulácii génovej expresie, transkripcie, alternatívneho zostrihu atď.

Čo je to mikrosatelit?

Mikrosatelit je časť DNA, ktorá má jednoduché opakovania sekvencií dlhé 1 až 10 bázových párov. Nazývajú sa aj mikrosatelity opakovania krátkej sekvencie (SSR) alebo jednoduché tandemové opakovania (STR).  Existujú dva typy mikrosatelitov, ktoré sa nazývajú jednoduché mikrosatelity a zložené mikrosatelity. Jednoduché mikrosatelity pozostávajú iba z jedného typu opakovaných sekvencií. Kompozitné mikrosatelity pozostávajú z viac ako jedného typu opakovaní. Mikrosatelity majú najčastejšie poly A / T oblasti. Mikrosatelity sú v eukaryotických genómoch spoločné a bohaté.

Podobne ako minisatelity aj mikrosatelity vykazujú medzi jednotlivcami polymorfizmus. Počet opakovaní pre daný mikrosatelit sa medzi jednotlivcami líši. Preto sa mikrosatelity môžu použiť aj ako genetické markery pri odoberaní DNA. Polymorfizmus mikrosatelitov možno ľahko identifikovať pomocou PCR a gélovej elektroforézy. Priľahlá oblasť mikrosatelitu je u príbuzných druhov vysoko konzervovaná.

Aké sú podobnosti medzi minisatelitom a mikrosatelitom?

• Minisatelity a mikrosatelity sú nekódujúce sekvencie DNA.
• Obaja sú tandemové opakovania.
• Obidve pozostávajú z vysoko sa opakujúcich sekvencií.
• Obidva môžu byť použité ako silné genetické markery pre DNA fingerprinting.

Aký je rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom?

Minisatellite verzus Microsatellite
Minisatelity sú tandemové opakovania s dĺžkou opakovania monoméru 10 až 100 párov báz.	Mikrosatelity sú krátke tandemové repetície, ktoré pozostávajú z opakujúcich sa monomérov s 1 až 9 pármi báz.
Veľkosť opakujúcej sa sekvencie
Minisatellit má opakujúce sa sekvencie 10 až 100 párov báz.	Mikrosatelit má krátke sekvencie 1 až 9 párov báz.
Bežné základy
Minisatelity sú bohaté na bázy G a C.	Mikrosatelity sú bohaté na bázy A a T.
Ostatné mená
Minisatelity sú známe aj ako tandemové opakovania s premenlivým počtom (VNTR).	Mikrosatelity sú známe aj ako krátke sekvenčné opakovania (SSR) alebo jednoduché tandemové opakovania (STR).

Zhrnutie - Minisatellit vs Microsatellite

Minisatelit a mikrosatelit sú dva typy tandemových opakovaní. Rozlišujú sa na základe počtu báz v opakujúcej sa sekvencii alebo veľkosti sekvencie. Minisatellit má opakujúcu sa sekvenciu s dĺžkou 10 až 100 bázových párov, zatiaľ čo mikrosatelit má opakujúcu sa sekvenciu s dĺžkou 1 až 9 bázových párov. Toto je hlavný rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom. Počet kópií opakujúcich sa sekvencií v minisatelitoch a mikrosatelitoch sa medzi jednotlivcami značne líši. Minisatelity a mikrosatelity sú silnými markermi DNA na analýzu genetických variácií v populáciách druhov a medzi populáciami druhov.

Stiahnite si PDF verziu Minisatellite verzus Microsatellite

Môžete si stiahnuť verziu tohto článku PDF a použiť ju na účely offline podľa citačných poznámok. Stiahnite si PDF verziu tu Rozdiel medzi minisatelitmi a mikrosatelitmi.

Referencie:

1.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Hlavné rozdiely." Rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom. N.p., n.d. Web. K dispozícii tu. 06. júl 2017.
2.Vieira, Maria Lucia Carneiro, Luciane Santini, Augusto Lima Diniz a Carla De Freitas Munhoz. "Mikrosatelitné markery: čo znamenajú a prečo sú také užitočné." Genetika a molekulárna biológia. Sociedade Brasileira de Genética, 2016. Web. K dispozícii tu. 7. júla 2017.

S láskavým dovolením:

1. „VNTRexample“ od Madelyndotson - vlastná práca (CC BY-SA 4.0) cez Commons Wikimedia