Rozdiel medzi proteomikou a metabolomikami

kľúčový rozdiel medzi proteomikou a metabolomikou je to proteomika je štúdium všetkých proteínov organizmu, zatiaľ čo metabolomika je štúdium všetkých metabolitov organizmu.

Genomika je štúdium genetického zloženia organizmu. Proteomika a metabolomika sú dve omické vedy súvisiace s genomikou. Proteóm označuje všetky proteíny v bunke alebo organizme. Na druhej strane sa metabolom týka všetkých metabolitov organizmu. Štúdium proteómu je teda proteomika, zatiaľ čo štúdium metabolom je metabolomika. Proteomika aj metabolomika sú dôležité pri diagnostike chorôb a pri charakterizácii a skríningu organizmov. Okrem toho sú obidve spojené v mnohých aspektoch bunkovej biológie, najmä v signalizácii buniek, degradácii a tvorbe proteínov a posttranslačných modifikáciách.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to proteomika
3. Čo sú metabolomiká
4. Podobnosti medzi proteomikou a metabolomikou
5. Porovnanie vedľa seba - proteomika verzus metabolomika v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je to proteomika?

Proteóm je celkový proteínový doplnok v bunke, tkanive alebo organizme. Preto je proteomika štúdiom proteómu organizmu. V proteomike sa analyzujú rôzne vlastnosti proteínov. Preto sa proteomika zameriava hlavne na štruktúru, orientáciu, funkcie, proteínové interakcie, modifikácie, aplikácie a dôležitosť proteínov. Preto je v súčasnosti veľa výskumných projektov v oblasti proteomiky.

Uskutočnili sa prvé proteomické štúdie na identifikáciu obsahu proteínov v Escherichia coli. Mapovanie celkového obsahu proteínov sa uskutočnilo pomocou dvojrozmerných (2D) gélov. Po úspechu tohto projektu sa vedci pokúsili charakterizovať celkový obsah bielkovín u zvierat, ako sú morčatá a myši. V súčasnosti sa mapovanie ľudských proteínov uskutočňuje pomocou 2D gélovej elektroforézy.

Štúdium proteomiky má veľa výhod, pretože proteíny sú vládnucimi molekulami s najväčšou aktivitou v dôsledku katalytickej vlastnosti proteínov. Štúdium celých proteínov tak môže poskytnúť informácie týkajúce sa zdravotného stavu organizmu. Okrem toho má proteomika veľa aplikácií pri anotácii genómu, identifikácii a diagnostike chorôb, pri štúdiách expresie proteínov počas experimentov a pri štúdiách modifikácie a interakcie proteínov atď..

Obrázok 01: Proteomika

V proteomike sa vyskytujú rôzne techniky, vrátane extrakcie celkového proteínu, ich separácie pomocou elektroforézy v 2D géli, sekvenovania extrahovaných proteínov pomocou metód, ako je Edmundova sekvenčná metóda alebo hmotnostná spektrometria a analýza štruktúrnych a funkčných vlastností proteínu pomocou Počítačové softvérové ​​a bioinformatické nástroje.

Čo je metabolomika?

Metabolomika je štúdia všetkých metabolitov v bunke, tkanive alebo organizme. Zahŕňa identifikáciu a kvantifikáciu bunkových metabolitov pomocou rôznych pokročilých analytických a štatistických nástrojov. Metabolomika je dôležitá štúdia, pretože odhaľuje informácie týkajúce sa metabolizmu organizmu.

Obrázok 02: Metabolomiká

Na štúdium substrátov a produktov metabolických reakcií metabolomika využíva ako analytickú platformu hmotnostnú spektrometriu. Výsledkom hmotnostnej spektrometrie sú metabolity a ich koncentrácie, ktoré odrážajú skutočný biochemický stav buniek alebo tkanív. Preto možno metabolomiku považovať za najlepšiu reprezentáciu molekulárneho fenotypu organizmu. Okrem toho sa metabolomiká môžu považovať za rozšírenie proteomiky, pretože väčšina metabolitov sa vytvára v dôsledku aktivity enzýmov, ktoré sú proteínmi..

Aké sú podobnosti medzi proteomikou a metabolomikou?

• Proteomika a metabolomika sú dve omické vedy súvisiace s genomikou.
• Metabolomiká sa môžu považovať za rozšírenie proteomiky.
• Proteóm a metabolón sú úzko späté s mnohými štúdiami.

Aký je rozdiel medzi proteomikou a metabolomikou?

Proteomika je rozsiahle štúdium proteínov vrátane ich štruktúry a funkcie v bunke alebo organizme. Medzitým je metabolomika štúdiom metabolitových profilov v bunke, tkanive alebo organizme v danom súbore podmienok. Toto je hlavný rozdiel medzi proteomikou a metabolomikou. Okrem toho sa proteomika týka predovšetkým kompletného súboru proteínov, zatiaľ čo metabolomika sa týka najmä kompletného súboru metabolitov, vrátane rozmanitého radu malých molekúl, ako sú peptidy, uhľohydráty, lipidy, nukleozidy a katabolické produkty exogénnych zlúčenín atď. ďalší rozdiel medzi proteomikou a metabolomikami.

Nižšie uvedený infographic sumarizuje rozdiel medzi proteomikou a metabolomikou.

Zhrnutie - Proteomics vs Metabolomics

Živé organizmy je možné študovať pomocou ich genómu, proteínov a metabolitov. Genomika, proteomika a metabolomika sú tri oblasti, ktoré študujú genetické zloženie, proteíny a metabolity bunky alebo organizmu. Proteomika je dôležitá, pretože ide o dynamickú reflexiu génov a prostredia. Metabolomika je veľmi dôležitá, pretože priamo odráža aktuálny stav biochemickej reakcie buniek alebo metabolický stav organizmu. To sumarizuje rozdiel medzi proteomikou a metabolomikou.

referencie:

1. P, Surat. „Ako súvisia metabolizmus a bielkoviny?“ Správy, 26. februára 2019, k dispozícii tu.
2. Horgan, Richard P. a Louise C. Kenny. „SAC Review 'Omic' Technologies: Genomics, Transcriptomics, Proteomics and Metabolomics.“ Pôrodníctvo a gynekológia, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18. júla 2011, k dispozícii tu.

S láskavým dovolením:

1. „Proteomika“ od Xxl7441 v anglických wikibookoch - prevedené z en.wikibookov na Commons. (Public Domain) prostredníctvom Commons Wikimedia
2. „Metabolomická schéma“ od Lmaps (talk) - túto prácu som vytvoril sám (CC BY-SA 3.0) prostredníctvom Commons Wikimedia.