Rozdiel medzi RNASE A a RNASE H

Kľúčový rozdiel - RNASE A verzus RNASE H
 

Ribonukleázy sú nukleázy, ktoré špecificky degradujú RNA na menšie jednotky. Dajú sa rozdeliť do dvoch kategórií; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, ktorá môže degradovať jednovláknovú alebo dvojvláknovú RNA. Štiepi fosfodiesterové väzby v RNA polynukleotidovom reťazci. Príkladmi sú RNáza A, RNáza III, RNáza Tl, RNáza P a RNáza H. Exoribonukleáza je exonukleáza, ktorá degraduje RNA odstránením terminálnych nukleotidov buď z 5 'alebo 3' konca molekuly RNA. Príkladmi sú RNáza R, RNáza II, RNáza D a RNáza PH. kľúčový rozdiel medzi RNASE A a RNASE H je to, že RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky degraduje jednovláknovú RNA na menšie zložky, zatiaľ čo RNáza H je nešpecifický enzým, ktorý štiepi RNA v hybride RNA-DNA na menšie jednotky prostredníctvom hydrolytického mechanizmu..

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je RNASE A
3. Čo je RNASE H
4. Podobnosti medzi RNASE A a RNASE H
5. Porovnanie vedľa seba - RNASE A verzus RNASE H v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je RNASE A?

RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi nespárované zvyšky cytozínu a uracilu na 3 'konci jednovláknovej RNA. RNáza H pracuje pri vyššej koncentrácii soli (0,3 M alebo vyššia koncentrácia NaCl). Hydrolytická reakcia je dvoma krokmi. Tvorí 3 'fosforylovaný produkt prostredníctvom 2', 3 'cyklického monofosfátového medziproduktu. Aj keď je špecifický pre jednovláknovú RNA pri vyššej koncentrácii soli, môže tiež degradovať dvojvláknovú RNA a RNA v hybride RNA-DNA pri nižšej koncentrácii NaCl (nižšia ako 0,3 M NaCl)..

Bruce Merrifield najskôr syntetizoval tento enzým. RNáza A je v molekulárnom výskume veľmi obľúbeným enzýmom. Hovädzia pankreatická RNáza A je príkladom RNázy A. A je to jeden z najťažších enzýmov, ktoré sa používajú v laboratóriu. Tento enzým nepotrebuje kofaktor pre svoju aktivitu. Je to vysoko termostabilný enzým. RNáza A je prvý enzým a tretí proteín, u ktorého bola detegovaná správna aminokyselinová sekvencia. Tento enzým je veľmi malý so 124 aminokyselinami a molekulovou hmotnosťou 12600da. A má štyri zvyšky histidínu (His 12 a His 119, ktoré sa podieľajú na katalytickej reakcii).

Obrázok 01: RNáza A

RNáza A sa môže izolovať varom surovej vzorky. Keď vrie, všetky ostatné enzýmy degradujú zostávajúcu RNázu A. RNáza A je úžasne stabilný enzým. Tento enzým inhibuje proteíny inhibítora ribonukleázy, komplexy ťažkých kovov a uridín vanadátu.

Čo je RNáza H?

RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže degradovať RNA v hybride RNA-DNA hydrolytickou reakciou. RNáza H štiepi 3'-O-P väzbu RNA v hybride RNA-DNA. Nakoniec vyrába produkty zakončené 3'OH a 5 'fosfátom. Pri replikácii DNA hrá kľúčovú úlohu odstránením priméru RNA po vytvorení nových reťazcov DNA. V laboratórnych podmienkach špecificky degraduje RNA v hybride RNA-DNA, ale nie v DNA a nehybridizovanej RNA. Tento enzým sa zvyčajne používa na zničenie templátu RNA po vytvorení prvého komplementárneho vlákna DNA počas syntézy cDNA.

Obrázok 02: RNáza H

RNáza H sa tiež používa v testoch na ochranu nukleáz. Môže byť tiež začlenený do odstránenia poly A chvosta z mRNA. RNáza H má schopnosť deštruktovať nekódujúcu RNA vo vnútri a mimo bunky. Kovové ióny sú potrebné ako kofaktory pre túto proteínovú aktivitu. Chelátor (EDTA) sa môže použiť na inhibíciu enzýmu RNázy H.

Aké sú podobnosti medzi RNASE A a RNASE H.?

• Obidve sú proteínovej povahy.
• Obidve sú endoribonukleáza
• Obe môžu degradovať RNA.
• Obidve uskutočňujú hydrolytické reakcie.
• Molekulárne laboratóriá ich používajú.

Aký je rozdiel medzi RNASE A a RNASE H?

RNASE A vs. RNASE H
RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi 3 'koniec nepárových cytozínových a uracilových zvyškov jednovláknovej RNA pri vyššej koncentrácii soli..	RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže degradovať RNA v hybride RNA-DNA hydrolytickou reakciou.
Povaha štiepenia RNA
RNáza A špecificky štiepi jednovláknovú RNA pri vyššej koncentrácii soli.	RNáza H štiepi RNA v RNA-DNA hybrid.
Potreba kofaktorov pre aktivitu
RNáza A nepotrebuje kofaktory pre svoju aktivitu.	RNáza H potrebuje pre svoju aktivitu kovové ióny ako kofaktory.
Inhibítory proteínovej aktivity
Proteín inhibítora ribonukleázy, komplexy ťažkých kovov a uridín vanadátu inhibujú aktivitu RNAsy A.	Chelátor (EDTA) inhibuje aktivitu RNázy H.
Odstránenie priméru RNA pri replikácii DNA
RNáza A sa pri replikácii DNA nepoužíva na odstránenie priméru RNA.	RNáza H sa používa na odstránenie priméru RNA pri replikácii DNA
Odstránenie templátu DNA v doplnkovej syntéze DNA (C-DNA)
RNáza A sa nepoužíva na odstránenie templátu RNA počas syntézy komplementárnej DNA (C-DNA).	RNáza H sa používa na odstránenie templátu RNA počas syntézy komplementárnej DNA (C-DNA).
Odstránenie poly-A-chvosta v mRNA hybridizovanej na oligo (dt)
RNáza A sa nepoužíva na odstránenie „poly-A chvosta“ v mRNA hybridizovanej na oligo (dt).	RNáza H sa používa na odstránenie „poly-A chvosta“ v mRNA hybridizovanej na oligo (dt)

zhrnutie - RNASE A vs. RNASE H

Ribonukleázy sú nukleázové enzýmy, ktoré majú schopnosť štiepiť RNA na menšie jednotky. Sú to dva typy; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, ktorá má schopnosť degradovať jednovláknovú alebo dvojvláknovú RNA. A štiepi fosfodiesterovú väzbu v RNA polynukleotidovom reťazci. RNáza A a RNáza H sú dve endoribonukleázy. RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi nespárované zvyšky cytozínu a uracilu na 3 'konci jednovláknovej RNA pri vyššej koncentrácii soli. RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže degradovať RNA v hybride RNA-DNA hydrolytickou reakciou. Toto je rozdiel medzi RNázou A a RNázou H.

Stiahnite si PDF RNASE A vs RNASE H

Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ju na účely offline podľa citácie. Stiahnite si PDF verziu tu Rozdiel medzi RNASE A a RNASE H

referencie:

1.Karuturi, autor Amrutha. „17 potrebuje vedieť fakty o RNase A.“ AG Blog, 22. februára 2017. K dispozícii tu
2. "ribonukleázy". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5. januára 2018. K dispozícii tu  

S láskavým dovolením:

1.'RNase A'By Nebol poskytnutý žiadny strojovo čitateľný autor. Vossman prevzal (na základe nárokov na autorské práva)., (CC BY-SA 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Nebol poskytnutý žiadny strojovo čitateľný autor. Vossman prevzal (na základe nárokov na autorské práva)., (CC BY-SA 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia