Rozdiel medzi stohovacím gélom a separačným gélom

Kľúčový rozdiel - stohovací gél vs separácia gél
 

Termíny stohovací gél a separačný gél sa používajú pri vysvetľovaní techniky SDS-PAGE. Elektroforéza na SDS-PAGE alebo elektroforéza na polyakrylamidovom géli dodecylsulfátu sodného je laboratórna technika, ktorá sa používa na oddelenie proteínových molekúl na základe ich molekulových hmotností. Teória techniky spočíva v tom, že proteíny s rôznymi molekulovými hmotnosťami vykazujú rôzne rýchlosti migrácie; molekuly s nízkou molekulovou hmotnosťou migrujú rýchlejšie, zatiaľ čo molekuly s vysokou molekulovou hmotnosťou migrujú pomaly. Médiom na migráciu je gél. Existujú dva typy gélov nazývaných stohovací gél a separačný gél. kľúčový rozdiel medzi stohovacím gélom a separačným gélom je to pH stohovacieho gélu je 6,8, zatiaľ čo pH separačného gélu je 8,8.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je to stohovací gél
3. Čo je separačný gél
4. Vzťah medzi stohovacím gélom a separačným gélom
5. Porovnanie vedľa seba - stohovací gél vs separačný gél v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie

Čo je to stohovací gél?

Stohovací gél je nízko koncentrovaný polyakrylamidový gél, ktorý sa umiestni na vrch koncentrovanejšieho štiepiaceho gélu (separačný gél) technikou SDS-PAGE. Stohovací gél sa používa na zlepšenie rozlíšenia elektroforézou. Rozlíšenie sa zvyšuje kvôli rozdielu medzi koncentráciami stohovacieho gélu a štiepiaceho gélu, ktoré ovplyvňujú proteíny vo vzorke. Pretože koncentrácia polyakrylamidu v stohovacom géli je nízka, veľkosť pórov je vyššia. To tiež pomáha pri zvyšovaní oddelenia.

Stohovací gél je sypký polyakrylamidový gél s veľkými pórmi asi 7% polyakrylamidu. Tieto póry nepôsobia ako veľká bariéra pre veľké proteínové molekuly. Preto tento gél mierne ovplyvňuje mobilitu týchto proteínov. Toto umožňuje separáciu podľa mobility a veľkosti proteínu ich koncentráciou medzi dvoma gélmi.

Obrázok 01: Akrylamidový gél SDS-PAGE

PH stohovacieho gélu je 6,8. Jeho pH je kyslé ako pH štiepiaceho gélu o 2 jednotky pH. Toto pH znamená nižšiu iónovú silu a teda vyšší elektrický odpor. To vyvoláva mobilitu proteínov ako iné nabité častice prítomné v géli.

Čo je separačný gél?

Separačný gél alebo štiepiaci gél technológie SDS-PAGE je vysoko koncentrovaný polyakrylamidový gél, ktorý sa umiestni na vrch nízko koncentrovaného stohovacieho gélu. Separačný gél obsahuje vysoké množstvo polyakrylamidu (10%). PH tohto gélu sa udržiava na pH = 8,8, čo je vyššia hodnota pH ako na stohovacom géli.

Obrázok 02: Gélové elektroforetické zariadenie

Keď proteínové molekuly dosiahnu separačný gél, migrácia týchto molekúl sa spomalí, pretože separačný gél je vysoko koncentrovaný gél s malou veľkosťou pórov, ktorý môže pôsobiť ako značná bariéra pre pohyb proteínových molekúl. Toto spomalenie umožňuje ostatným proteínom pomaly migrovať, aby ich dohnali, čo vedie k úzkemu koncentrovanému pruhu medzi dvoma gélmi.

Aký je vzťah medzi stohovacím gélom a separačným gélom?

• Ako stohovací gél, tak aj separačný gél sa používajú v rovnakom prístroji.

Aký je rozdiel medzi stohovacím gélom a separačným gélom?

Stohovací gél vs separačný gél
Stohovací gél je nízko koncentrovaný polyakrylamidový gél, ktorý sa umiestni na vrch koncentrovanejšieho štiepiaceho gélu (separačný gél) technikou SDS-PAGE..	Separačný gél alebo štiepiaci gél techniky SDS-PAGE je vysoko koncentrovaný polyakrylamidový gél, ktorý sa umiestni na vrch nízko koncentrovaného stohovacieho gélu..
umiestnenia
Stohovací gél sa umiestni na štiepiaci (separačný) gél.	Separačný gél sa umiestni na dno nádoby použitej na gélovú elektroforézu.
sústredenie
Koncentrácia stohovacieho gélu je vysoká.	Koncentrácia separačného gélu je nízka.
Obsah polyakrylamidu
Stohovací gél obsahuje asi 7% polyakrylamidu.	Separačný gél obsahuje asi 10% polyakrylamidu.
pH
PH stohovacieho gélu je 6,8.	PH separačného gélu je 8,8.
Veľkosť pórov
V stohovacom géli sú veľké póry.	V separačnom géli sú prítomné malé veľkosti pórov.
Rozhodnutie
Stohovací gél poskytuje lepšie rozlíšenie.	Separačný gél poskytuje zlé rozlíšenie.

zhrnutie - Stacking Gel vs Separating gél

Stohovací gél a separačný gél sú dva typy polyakrylamidových gélov, ktoré sa používajú na lepšie oddelenie molekúl proteínov v danej vzorke. Rozdiel medzi stohovacím gélom a separačným gélom je v tom, že pH stohovacieho gélu je 6,8, zatiaľ čo pH separačného gélu je 8,8..

referencie:

1. „Elektroforéza na polyakrylamidovom géli.“ Elektroforéza na polyakrylamidovom géli (teória): Molecular Biology Virtual Lab II: Biotechnology and Biomedical Engineering: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. K dispozícii tu  
2. „Ako funguje SDS-PAGE.“ Bitesize Bio, 16. februára 2018. K dispozícii tu
3. „Stohovací gél SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew).“ Webové stránky Google. K dispozícii tu 

S láskavým dovolením:

1.'SDS-PAGE akrylamidový gél'Byaccount na anglickej Wikipédii (CC BY 3.0) prostredníctvom Wikimedia Commons  
2. „Gélový elektroforetický prístroj“ Autor: Jeffrey M. Vinocur - Vlastné dielo (CC-BY 2.5) prostredníctvom Commons Wikimedia