Rozdiel medzi hornou a dolnou DNA

Kľúčový rozdiel - proti smeru toku DNA proti prúdu
 

Je dôležité mať všeobecné vedomosti o zložení a štruktúre DNA, aby sme pochopili rozdiel medzi DNA v smere a proti prúdu. DNA sa skladá z polynukleotidových reťazcov. Nukleotidy sú stavebné bloky, ktoré vytvárajú polynukleotidové reťazce a každý nukleotid je vyrobený z troch zložiek: päť uhlíkového cukru, dusíkatej bázy a fosfátovej skupiny. Fosfátová skupina a skupina OH sú pripojené k 5 'polohe uhlíka a 3' pozícii uhlíka molekuly cukru v nukleotide, v danom poradí. Nukleotidy sú spojené fosfodiesterovými väzbami vytvorenými medzi 5 'fosfátovou skupinou jedného nukleotidu a 3' OH skupinou susedného nukleotidu. Ak má polynukleotidový reťazec voľnú 5 'fosfátovú skupinu, je priradený ako 5' koniec; ak má voľnú 3 'OH skupinu, je priradená ako 3' koniec. Preto majú vlákna DNA obvykle 5 'a 3' konce podľa koncových polôh polynukleotidových reťazcov. DNA tiež existuje ako dvojvláknová forma. Dva pramene sú proti sebe navzájom rovnobežné. DNA má preto dva vlákna, ktoré prebiehajú v smere 5 'až 3' a 3 'až 5'. Upstream a downstream DNA sa označuje s odkazom na transkripciu a syntézu 5 'až 3' vlákna mRNA. Ak je DNA považovaná za 5 koniec kódovacieho vlákna od iniciačného miesta transkripcie, je známa ako upstream DNA. Ak sa DNA považuje za 3 'koniec od kódujúceho vlákna z miesta iniciácie transkripcie, je známa ako downstream DNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi protiprúdnou a downstreamovou DNA.

OBSAH
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je DNA proti smeru toku
3. Čo je downstream DNA
4. Porovnanie vedľa seba - proti smeru toku DNA proti prúdu
5. Zhrnutie

Čo je DNA proti smeru toku?

Gén je dedičnosť štruktúrnej a funkčnej jednotky, ktorá sa nachádza na DNA organizmu. Je uložený s inštrukciami na zostavenie proteínu. Gén má špecifickú oblasť molekuly DNA. Ak je to potrebné, transkribuje a translatuje sa na proteín prostredníctvom syntézy vlákna mRNA. Normálne kódujúce vlákno génu prebieha z 5 'na 3' smer. Keď je transkribovaný, vytvára vlákno mRNA v rovnakom smere 5 'až 3'. Počas transkripcie slúži 3 'až 5' antisense vlákno ako templátové vlákno a iniciuje syntézu mRNA. V géne je miesto začatia transkripcie. S odkazom na miesto začatia transkripcie je oblasť DNA smerom k 5 'koncu kódujúceho vlákna známa ako upstream DNA. Promótor génu je normálne umiestnený v upstream oblasti DNA. V eukaryotických génoch sú oblasti TATA, promótorové proximálne prvky a zosilňovače v oblasti proti prúdu génu. Horná časť génu je označená zápornými číslami. Upstream DNA génu má pre transkripciu mimoriadny význam.

Čo je downstream DNA?

Miesto začatia transkripcie je známe ako +1 bod génu. DNA oblasť od +1 bodu smerom k 3 'koncu kódujúceho vlákna je známa ako downstream DNA. Inými slovami, downstream od génu je od iniciačného miesta transkripcie smerom k 5 'koncu templátového vlákna. Preto downstream DNA génovej oblasti obsahuje transkripčnú jednotku a ďalšie sekvencie, ako je terminátorová sekvencia. Promótor môže ovplyvniť downstream sekvenciu génu. Na dolnú časť génu sa vzťahujú kladné čísla. Následná DNA génu je skutočná oblasť, ktorá poskytuje proteínový produkt.

Obrázok 01: Proti smeru a po smere DNA

Aký je rozdiel medzi hornou a dolnou DNA?

Proti prúdu proti DNA proti smeru toku
DNA oblasť smerom k 5 'koncu kódujúcej sekvencie z miesta iniciácie transkripcie je známa ako upstream DNA.	DNA oblasť smerom k 3 'koncu kódujúceho vlákna z miesta iniciácie transkripcie je známa ako downstream DNA.
elements
Promótory a zosilňovače sú umiestnené na upstream DNA	Transkripčná jednotka a terminátorové sekvencie sú umiestnené v downstream DNA.
číslovanie
Nukleotidy v protiprúdovej oblasti sú označené zápornými číslami	Nukleotidy sa označujú kladnými číslami.
funkcie
Táto oblasť obsahuje prvky potrebné na reguláciu a začatie transkripcie	Táto oblasť obsahuje inštrukcie na produkciu proteínu a ukončenie transkripcie

Zhrnutie - proti smeru toku DNA proti smeru toku

Je ľahké identifikovať upstream a downstream RNA vlákna. Pokiaľ ide o referenčné miesto, oblasť smerom k 5 'koncu reťazca RNA je známa ako upstream RNA, zatiaľ čo oblasť smerom k 3' koncu je známa ako downstream RNA. Avšak v DNA existujú dva vlákna, ktoré prebiehajú v oboch smeroch 5 'až 3' a 3 'až 5'. Preto je rozdiel medzi DNA proti smeru toku a proti smeru toku komplikovaný. Preto je diferencovaná podľa transkripcie génu. Z iniciačného miesta transkripcie smerom k 5 koncom sense vlákna sa oblasť DNA označuje ako upstream DNA, zatiaľ čo od iniciačného miesta transkripcie smerom k 3 'konci sense vlákna sa nazýva downstream DNA. Toto je rozdiel medzi upstream a downstream DNA.

Referencie:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi a Jonatha M. Gott. „Odlišné úlohy pre sekvencie pred a za fyzareaktívnymi miestami.“ RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Web. 18. marca 2017

S láskavým dovolením:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro a Luísa Romão. „Regulácia génovej expresie v otvorených čítacích rámcoch a chorobe ľudí.“ Genetika PLOS. Public Library of Science, n.d. Web. 18. marca 2017.