Rozdiel medzi aktívnym a záväzným miestom

kľúčový rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom je to aktívne miesto napomáha katalýze chemickej reakcie, zatiaľ čo väzobné miesto pomáha pri naviazaní ligandu na veľkú molekulu.

Väzbové miesto je oblasť na proteíne, DNA alebo RNA, na ktorú sa môže viazať ligand. Enzýmy sú proteíny. Aktívne miesto je oblasť enzýmu, na ktorú sa substráty môžu viazať, aby sa podrobili chemickej reakcii. Táto špecifická oblasť má tiež väzobné miesto spolu s katalytickým miestom. Preto väzobné miesta pomáhajú iba pri väzbe ligandu na veľkú molekulu, zatiaľ čo aktívne miesta napomáhajú tak väzbe ligandu k veľkej molekule, zatiaľ čo sa nechajú podrobiť katalyzovanej chemickej reakcii.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je aktívna stránka
3. Čo je záväzná stránka
4. Porovnanie bok po boku - aktívne stránky verzus väzobné stránky v tabuľkovej forme
5. Zhrnutie

Čo je to aktívna stránka?

Aktívne miesto je oblasť na enzýme, na ktorý sa viažu substráty chemickej reakcie, aby sa podrobila katalyzovanej chemickej reakcii. táto oblasť pozostáva z dvoch subregiónov ako väzobné miesto a katalytické miesto. Väzbové miesto obsahuje niektoré zvyšky, ktoré môžu pomôcť pri naviazaní substrátu (reaktantov) na enzým. Katalytické miesto pomáha pri katalyzovaní chemickej reakcie. Okrem toho je táto oblasť v porovnaní s celým objemom enzýmu veľmi malá; približne 10 až 20% z celkového objemu enzýmu.

Obrázok 01: Záväzné miesto a katalytické miesto aktívneho miesta

Zvyčajne aktívne miesto obsahuje 3 až 4 aminokyseliny. zvyšok aminokyselín v enzýme, ktorý sa podieľa na udržiavaní terciárnej štruktúry enzýmu. Dôležitejšie je, že aktívne miesto má špecifický dizajn, ktorý sa zmestí na špecifický substrát. Preto tieto enzýmy reagujú iba s konkrétnymi substrátmi. Enzýmy však niekedy potrebujú pre svoju funkciu kofaktory. Hlavnou funkciou aktívneho miesta je zníženie aktivačnej energie chemickej reakcie, a tým zvýšenie reakčnej rýchlosti.

Čo je záväzná stránka?

Väzbové miesto je oblasť na proteíne, DNA alebo RNA, na ktorú sa môžu viazať ligandy. Tam môže ligand s týmto miestom tvoriť chemickú väzbu. Tieto regióny vykazujú špecifickosť; konkrétny ligand sa bude viazať na konkrétne väzobné miesto. Toto miesto je preto mierou typov ligandov, ktoré sa môžu viazať s molekulou.

Ďalej tieto regióny často využívame na funkčnú charakterizáciu biomolekúl. Napríklad môžeme charakterizovať funkčnosť aktívneho miesta prostredníctvom jeho väzbového miesta. Navyše v prípade DNA je špecifickým typom väzbového miesta väzbové miesto pre transkripčný faktor prítomné v DNA.

Aký je rozdiel medzi aktívnym a záväzným webom?

Aktívne miesto je oblasť na enzýme, na ktorý sa viažu substráty chemickej reakcie, aby sa podrobila katalyzovanej chemickej reakcii, zatiaľ čo väzbové miesto je oblasť na proteíne, DNA alebo RNA, na ktorú sa môžu viazať ligandy. Toto je kľúčový rozdiel medzi aktívnym a väzbovým miestom. Okrem toho sú aktívne enzýmy prítomné v enzýmoch a pomáhajú zvyšovať rýchlosť reakcie konkrétnej chemickej reakcie znižovaním bariéry aktivačnej energie pri tejto reakcii. Na druhej strane väzbové miesta sú zodpovedné za väzbu špecifického ligandu na konkrétnu molekulu.

Nižšie uvedený infographic predstavuje rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom v tabuľkovej forme.

Zhrnutie - aktívna stránka verzus záväzná stránka

Aktívne miesta sú oblasti enzýmov, ktoré môžu zvýšiť reakčnú rýchlosť chemickej reakcie znížením aktivačnej energetickej bariéry tejto reakcie. Väzbovým miestom je akákoľvek oblasť, na ktorú sa môže ligand viazať. Aktívne miesto tiež obsahuje väzobné miesto. Rozdiel medzi aktívnym a väzbovým miestom spočíva na existencii a funkčnosti. Kľúčovým rozdielom medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom je preto to, že aktívne miesto napomáha katalýze chemickej reakcie, zatiaľ čo väzobné miesto pomáha pri väzbe ligandu na veľkú molekulu..

referencie:

1. „Aktívne stránky“. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 24. júla 2018. K dispozícii tu 
2. „Záväzné stránky“. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 28. augusta 2018. K dispozícii tu 

S láskavým dovolením:

1. „Enzymatická štruktúra“ Thomas Shafee - vlastná práca (CC BY 4.0) prostredníctvom Commons Wikimedia