Rozdiel medzi Transpozónom a Retrotranspozónom

Transpozón vs Retrotranspozón

Transpozóny a retrotranspozóny sú genetické zložky DNA a medzi nimi sú veľké rozdiely. Percentuálna prítomnosť týchto genetických materiálov sa u jednotlivých druhov líši a ich funkcie určujú osudy organizmu s mutáciami a inými fenotypovo dôležitými zmenami. Transpozóny a retrotranspozóny sú gény alebo zbierky určitých génov nachádzajúcich sa v reťazcoch DNA a zmeny ich umiestnenia boli hlavnými príčinami týchto dôsledkov. Tento článok má však v úmysle stručne diskutovať o funkciách týchto génov a uvádza porovnanie transpozónov a retrotranspozónov..

Čo je Transposon?

Transpozóny sú zaujímavé fragmenty alebo segmenty DNA so schopnosťou zmeniť umiestnenie reťazca DNA vo forme mechanizmu vystrihnutia a vloženia. Kvôli tejto mobilnej povahe transpozónov sú tieto známe ako skákajúce gény. Transpozóny sú dva hlavné typy známe ako Transpozóny triedy I a Transpozóny triedy II. Typ triedy II sa zvyčajne označuje ako transpozóny a typ triedy I sa označuje ako retrotranspozóny. Procesy rezania a prilepovania mobilných segmentov DNA sú regulované enzýmom transposázou. Enzým sa viaže na oba konce transpozónu a štiepi fosfodiesterové väzby reťazca DNA, izoluje transpozón, presúva ho na cieľové miesto a viaže sa na nové miesto. Tento proces je však zaujímavý na pochopenie, pretože niektoré transpozóny sa môžu presunúť iba na určité miesta iba kvôli nekompatibilite bázových sekvencií s cieľovým miestom. Gény s jedným koncom jedného vlákna majú rovnakú bázovú sekvenciu s druhým koncom druhého vlákna sú transpozóny s lepkavými okrajmi, pretože sa môžu viazať na miesta cieľového vlákna DNA s rovnakou sekvenciou báz ako na lepkavých koncoch. , Táto mobilita génov však môže spôsobiť zmeny genotypu, ako aj fenotypu organizmu. Vedci vynašli informácie o transpozónoch a geneticky modifikovaných potravinách a organizmoch sa potom sprístupnili podľa preferovaných úprav. Vysoko produktívne poľnohospodárske plodiny, antibiotiká s liečivými vlastnosťami, hospodárske zvieratá boli niektoré z výhodne vyvinutých produktov po vynáleze transpozónov Barbary McClintockovej v 40. rokoch 20. storočia..

Čo je Retrotransposon?

Retrotranspozóny sú transpozóny triedy I a tie sa pohybujú v genóme mechanizmom kopírovania a vkladania. Mechanizmus mobility retrotranspozónov zahŕňa niekoľko hlavných krokov, ako je kopírovanie génového segmentu DNA reťazca do RNA, prenos kópie RNA do cieľového miesta, transkripcia RNA sekvencie späť do DNA pomocou reverznej transkriptázy a inzercia. génu do nového umiestnenia reťazca DNA genómu. Dva konce týchto retrotranspozónov majú obvykle dlhé terminálne repetície s asi 1 000 pármi báz a tieto konce sa používajú ako identifikačné znaky týchto génov. Tieto gény sa ľahko amplifikujú vo vnútri genómu a percento retrotranspozónov v ľudskom genóme je asi 50%. Tieto by mohli byť dosť nebezpečné, pretože pôvodca vírusu AIDS, HIV a leukémie T-buniek má vo svojich genómoch RNA retrotranspozóny. V skutočnosti môžu tieto vírusy viazať retrotranspozóny na akékoľvek miesto v reťazcoch ľudskej DNA pomocou reverznej transkriptázy a integrázy. Enzým integrázy funguje rovnako ako transpozáza v transpozónoch triedy II.